26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3905 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  100 
 
 
49 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  90 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  93.1 
 
 
346 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  90 
 
 
250 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  83.33 
 
 
250 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  83.33 
 
 
250 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  80 
 
 
319 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  72.22 
 
 
234 aa  52  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  83.33 
 
 
98 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  83.33 
 
 
75 aa  51.6  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  80 
 
 
250 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  70.73 
 
 
66 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  72.73 
 
 
250 aa  50.4  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  80 
 
 
250 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  82.76 
 
 
33 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  80 
 
 
227 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  80 
 
 
250 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  56.52 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  76.67 
 
 
246 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  80 
 
 
250 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  76.67 
 
 
250 aa  47  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  70 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  66.67 
 
 
346 aa  45.1  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  76 
 
 
53 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  63.33 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  64.29 
 
 
224 aa  40.8  0.007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>