21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2215 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2215    100 
 
 		 174 bp  345  2e-93  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    86.24 
 
 		 635 bp  97.6  9e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    84.17 
 
 		 748 bp  79.8  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    82.5 
 
 		 703 bp  73.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    81.95 
 
 		 707 bp  73.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  95.35 
 
 		 753 bp  69.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  95.35 
 
 		 753 bp  69.9  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90.38 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    92.5 
 
 		 716 bp  56  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    92.5 
 
 		 752 bp  56  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    92.5 
 
 		 752 bp  56  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  88.46 
 
 		 741 bp  56  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  88.46 
 
 		 753 bp  56  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  94.29 
 
 		 753 bp  54  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    90.48 
 
 		 972 bp  52  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    96.55 
 
 		 522 bp  50.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  90 
 
 		 753 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  90 
 
 		 1041 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  90 
 
 		 753 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  90 
 
 		 753 bp  48.1  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  91.43 
 
 		 753 bp  46.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>