26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3818 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3818    100 
 
 		 707 bp  1402    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    92.84 
 
 		 635 bp  573  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    81.41 
 
 		 703 bp  226  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    80.37 
 
 		 748 bp  178  9.999999999999999e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  82.95 
 
 		 240 bp  133  8.000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  78.61 
 
 		 675 bp  95.6  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  83.92 
 
 		 753 bp  93.7  6e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  80.31 
 
 		 753 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  80.31 
 
 		 753 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.18 
 
 		 960 bp  83.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  82.31 
 
 		 1041 bp  77.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  80.87 
 
 		 780 bp  77.8  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    81.95 
 
 		 174 bp  73.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    82.48 
 
 		 699 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  84.95 
 
 		 753 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    81.88 
 
 		 391 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  81.88 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.88 
 
 		 1041 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  85.53 
 
 		 684 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6484    84.72 
 
 		 189 bp  56  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0121127  normal  0.519788 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1565  hypothetical protein  85.48 
 
 		 240 bp  52  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    78.17 
 
 		 748 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  93.75 
 
 		 753 bp  48.1  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  81.48 
 
 		 753 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    82.89 
 
 		 754 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  86.54 
 
 		 753 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>