43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3910 on replicon NC_010578
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010580  Bind_3813    93.35 
 
 		 703 bp  1009    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    100 
 
 		 748 bp  1483    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    83.72 
 
 		 635 bp  371  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  83.86 
 
 		 780 bp  258  2.0000000000000002e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  88.26 
 
 		 240 bp  234  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    80.37 
 
 		 707 bp  178  1.9999999999999998e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1084    93.85 
 
 		 183 bp  97.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219897  normal  0.823309 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  83.22 
 
 		 753 bp  93.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  83.22 
 
 		 753 bp  93.7  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  85.05 
 
 		 1041 bp  85.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  81.58 
 
 		 753 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1565  hypothetical protein  89.71 
 
 		 240 bp  79.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    84.17 
 
 		 174 bp  79.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  77.75 
 
 		 675 bp  77.8  0.000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    81.05 
 
 		 699 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.67 
 
 		 1041 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.67 
 
 		 753 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6484    89.83 
 
 		 189 bp  69.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0121127  normal  0.519788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    86.49 
 
 		 522 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    83.67 
 
 		 195 bp  67.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    100 
 
 		 972 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    84.27 
 
 		 748 bp  65.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82.41 
 
 		 391 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    100 
 
 		 752 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 		 753 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.41 
 
 		 960 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    100 
 
 		 752 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  88.68 
 
 		 753 bp  58  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  96.88 
 
 		 684 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  94.44 
 
 		 753 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  96.88 
 
 		 753 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  96.88 
 
 		 741 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  84.51 
 
 		 675 bp  54  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    94.29 
 
 		 753 bp  54  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  80.33 
 
 		 753 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    94.12 
 
 		 450 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    85.96 
 
 		 456 bp  50.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  96.55 
 
 		 753 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1290  FAD linked oxidase-like  100 
 
 		 1419 bp  48.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    93.75 
 
 		 337 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    93.75 
 
 		 716 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    96.43 
 
 		 753 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    93.75 
 
 		 189 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>