43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2636 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2636    100 
 
 		 635 bp  1259    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    92.84 
 
 		 707 bp  573  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    82.93 
 
 		 703 bp  383  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    83.72 
 
 		 748 bp  371  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  82.87 
 
 		 780 bp  157  5e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  78.49 
 
 		 753 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  78.49 
 
 		 753 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.15 
 
 		 1041 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  84.15 
 
 		 753 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  83.63 
 
 		 753 bp  117  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    83.54 
 
 		 391 bp  111  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  83.33 
 
 		 960 bp  111  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  84.33 
 
 		 1041 bp  99.6  9e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    85.59 
 
 		 699 bp  99.6  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    86.24 
 
 		 174 bp  97.6  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  80.18 
 
 		 675 bp  93.7  6e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  81.32 
 
 		 753 bp  91.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  87.78 
 
 		 240 bp  91.7  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  82.1 
 
 		 684 bp  91.7  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.47 
 
 		 754 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  82.55 
 
 		 753 bp  81.8  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    84.31 
 
 		 752 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    85.11 
 
 		 522 bp  75.8  0.00000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  90.91 
 
 		 741 bp  69.9  0.0000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  80.38 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  97.37 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    82.46 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1084    89.66 
 
 		 183 bp  67.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219897  normal  0.823309 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  81.82 
 
 		 753 bp  65.9  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    79.02 
 
 		 748 bp  65.9  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    86.11 
 
 		 753 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    95 
 
 		 972 bp  63.9  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    81.3 
 
 		 753 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    97.06 
 
 		 752 bp  60  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  94.74 
 
 		 753 bp  60  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    82.65 
 
 		 195 bp  60  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    82.18 
 
 		 450 bp  58  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0375    84.51 
 
 		 290 bp  54  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.987683  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    92.11 
 
 		 456 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    92.11 
 
 		 716 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    92.11 
 
 		 189 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    92.11 
 
 		 337 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  81.82 
 
 		 705 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>