33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3813 on replicon NC_010580
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010578  Bind_3910    93.35 
 
 		 748 bp  1009    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    100 
 
 		 703 bp  1394    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    82.93 
 
 		 635 bp  383  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  80.35 
 
 		 780 bp  234  3e-59  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    81.41 
 
 		 707 bp  226  7e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  85.05 
 
 		 1041 bp  85.7  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1084    97.87 
 
 		 183 bp  85.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.219897  normal  0.823309 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  90.14 
 
 		 240 bp  85.7  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    85.39 
 
 		 748 bp  73.8  0.00000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    82.5 
 
 		 174 bp  73.8  0.00000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.67 
 
 		 1041 bp  69.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.67 
 
 		 753 bp  69.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  84.21 
 
 		 753 bp  69.9  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  92 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    83.67 
 
 		 195 bp  67.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  92 
 
 		 753 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    82.69 
 
 		 699 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1565  hypothetical protein  90.2 
 
 		 240 bp  61.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82.35 
 
 		 391 bp  60  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    85.14 
 
 		 522 bp  60  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  81.9 
 
 		 960 bp  58  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  83.15 
 
 		 675 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  94.44 
 
 		 753 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  96.88 
 
 		 684 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  89.58 
 
 		 753 bp  56  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    94.29 
 
 		 753 bp  54  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  92.11 
 
 		 753 bp  52  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    92.11 
 
 		 752 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  92.11 
 
 		 675 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    96.55 
 
 		 752 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  96.55 
 
 		 753 bp  50.1  0.0009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6484    91.67 
 
 		 189 bp  48.1  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0121127  normal  0.519788 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    93.75 
 
 		 450 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>