44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0824 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0824    100 
 
 
522 bp  1035    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    94.46 
 
 
716 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    87.83 
 
 
503 bp  452  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.34 
 
 
1041 bp  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    89.17 
 
 
699 bp  446  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87.17 
 
 
753 bp  436  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  85.9 
 
 
753 bp  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.06 
 
 
960 bp  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  85.65 
 
 
753 bp  389  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    86.21 
 
 
752 bp  381  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  85.52 
 
 
753 bp  375  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    84.63 
 
 
753 bp  343  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    85.89 
 
 
752 bp  343  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    84.51 
 
 
972 bp  341  9.999999999999999e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    85.43 
 
 
753 bp  329  5e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  85.35 
 
 
753 bp  325  7e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  83.78 
 
 
753 bp  313  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  84.67 
 
 
753 bp  305  7.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    84.63 
 
 
450 bp  303  3e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    83.64 
 
 
754 bp  293  3e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  82.3 
 
 
741 bp  276  6e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    86.16 
 
 
337 bp  270  4e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  82.48 
 
 
753 bp  268  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    83.38 
 
 
753 bp  264  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    82.99 
 
 
456 bp  250  3e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  82.87 
 
 
753 bp  248  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  85.42 
 
 
684 bp  238  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    82.87 
 
 
754 bp  238  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  86.94 
 
 
705 bp  232  8e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    88.49 
 
 
391 bp  149  9e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.79 
 
 
189 bp  127  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  85.21 
 
 
753 bp  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  85.21 
 
 
753 bp  115  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    80.7 
 
 
466 bp  77.8  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    85.11 
 
 
635 bp  75.8  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    86.49 
 
 
748 bp  67.9  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  97.37 
 
 
1041 bp  67.9  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    85.14 
 
 
703 bp  60  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  92.11 
 
 
675 bp  52  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  100 
 
 
780 bp  52  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    92.11 
 
 
195 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    96.55 
 
 
174 bp  50.1  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    82.11 
 
 
707 bp  46.1  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    81.93 
 
 
748 bp  46.1  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>