63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8273 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  87.25 
 
 
753 bp  731    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.45 
 
 
960 bp  795    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  90.65 
 
 
753 bp  930    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  88.79 
 
 
753 bp  819    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    100 
 
 
753 bp  1493    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    86.32 
 
 
752 bp  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  86.59 
 
 
753 bp  692    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87.12 
 
 
753 bp  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.7 
 
 
1041 bp  656    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.38 
 
 
753 bp  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    86.27 
 
 
753 bp  654    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  86.06 
 
 
753 bp  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  85.85 
 
 
741 bp  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    86.74 
 
 
972 bp  694    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  85.66 
 
 
753 bp  636  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    86.23 
 
 
699 bp  620  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.43 
 
 
754 bp  601  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  84.73 
 
 
753 bp  581  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    84.94 
 
 
754 bp  571  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    89.09 
 
 
503 bp  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  86.45 
 
 
684 bp  543  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    84.06 
 
 
752 bp  533  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    83.92 
 
 
753 bp  523  1e-146  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    87.93 
 
 
450 bp  450  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  87.15 
 
 
705 bp  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    84.63 
 
 
522 bp  343  4e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    92.83 
 
 
336 bp  335  1e-89  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    88.57 
 
 
337 bp  327  3e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    86.97 
 
 
716 bp  291  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    88.24 
 
 
309 bp  285  9e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    83.69 
 
 
456 bp  280  6e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  79.91 
 
 
753 bp  250  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  79.91 
 
 
753 bp  250  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82.95 
 
 
391 bp  236  7.000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  89.34 
 
 
297 bp  224  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    84.69 
 
 
219 bp  161  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    86.5 
 
 
189 bp  149  1e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    89.83 
 
 
135 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  89.26 
 
 
228 bp  137  5e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  89.34 
 
 
162 bp  131  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  88.24 
 
 
201 bp  125  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  87.93 
 
 
228 bp  119  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    85.6 
 
 
201 bp  105  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    82.46 
 
 
466 bp  101  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  87.25 
 
 
102 bp  99.6  1e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  83.08 
 
 
1041 bp  83.8  0.00000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  85.87 
 
 
207 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    84.11 
 
 
748 bp  77.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  86.05 
 
 
150 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  90.91 
 
 
120 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  86.3 
 
 
780 bp  65.9  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  81.45 
 
 
675 bp  63.9  0.00000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8020  hypothetical protein  91.49 
 
 
156 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256989  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    85.33 
 
 
195 bp  61.9  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    81.3 
 
 
635 bp  61.9  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3951  hypothetical protein  86.57 
 
 
111 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  89.09 
 
 
120 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    82.08 
 
 
243 bp  60  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    84.93 
 
 
105 bp  58  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    96.97 
 
 
104 bp  58  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  83.15 
 
 
225 bp  58  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  79.56 
 
 
675 bp  50.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1884    82.89 
 
 
168 bp  48.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>