54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3233 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3233    100 
 
 		 716 bp  1419    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    94.46 
 
 		 522 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.71 
 
 		 1041 bp  303  4e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    87.01 
 
 		 753 bp  293  4e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87.46 
 
 		 753 bp  291  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    86.97 
 
 		 753 bp  291  1e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    86.32 
 
 		 972 bp  276  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    86.78 
 
 		 752 bp  276  8.000000000000001e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  86.32 
 
 		 753 bp  276  8.000000000000001e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    87.77 
 
 		 503 bp  274  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    87.81 
 
 		 337 bp  272  1e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  86.04 
 
 		 753 bp  270  5e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.19 
 
 		 960 bp  264  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  85.86 
 
 		 753 bp  262  1e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  85.62 
 
 		 753 bp  258  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    85.34 
 
 		 450 bp  252  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    85.76 
 
 		 752 bp  252  1e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  85.02 
 
 		 753 bp  244  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  90.64 
 
 		 297 bp  244  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    84.36 
 
 		 753 bp  228  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    86.51 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  84.04 
 
 		 753 bp  220  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  84.41 
 
 		 753 bp  220  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    84.39 
 
 		 754 bp  208  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  87.92 
 
 		 753 bp  204  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  82.74 
 
 		 741 bp  202  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  84.73 
 
 		 705 bp  202  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  87.37 
 
 		 684 bp  194  2e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    83.05 
 
 		 699 bp  188  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    85.32 
 
 		 336 bp  178  9.999999999999999e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.42 
 
 		 754 bp  174  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    82.01 
 
 		 456 bp  155  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    84.54 
 
 		 219 bp  149  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  89.08 
 
 		 201 bp  125  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  84.77 
 
 		 753 bp  117  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  84.77 
 
 		 753 bp  117  5e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    87.07 
 
 		 189 bp  111  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  86.01 
 
 		 162 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  89.29 
 
 		 225 bp  95.6  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    81.87 
 
 		 466 bp  93.7  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    81.18 
 
 		 391 bp  83.8  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    84.75 
 
 		 135 bp  83.8  0.00000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  84.3 
 
 		 228 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  84.48 
 
 		 228 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  85 
 
 		 102 bp  71.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    92.5 
 
 		 174 bp  56  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  94.44 
 
 		 120 bp  56  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  100 
 
 		 675 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  100 
 
 		 1041 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  84.62 
 
 		 207 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    92.11 
 
 		 635 bp  52  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  91.67 
 
 		 150 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  91.67 
 
 		 120 bp  48.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    93.75 
 
 		 748 bp  48.1  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>