60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3932 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  88.34 
 
 		 753 bp  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  86.09 
 
 		 753 bp  640    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    95.36 
 
 		 752 bp  1201    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    100 
 
 		 754 bp  1495    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  85.81 
 
 		 753 bp  617  9.999999999999999e-175  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  85.81 
 
 		 753 bp  617  9.999999999999999e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    85.43 
 
 		 753 bp  601  1e-169  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  85.17 
 
 		 753 bp  585  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    85.79 
 
 		 753 bp  587  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    85.08 
 
 		 972 bp  563  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.33 
 
 		 1041 bp  557  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  84.74 
 
 		 753 bp  553  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  84.64 
 
 		 753 bp  553  1e-155  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  84.34 
 
 		 741 bp  543  9.999999999999999e-153  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.52 
 
 		 960 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    83.98 
 
 		 752 bp  498  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  83.58 
 
 		 753 bp  482  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    84.02 
 
 		 699 bp  478  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  83.4 
 
 		 753 bp  474  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    82.78 
 
 		 753 bp  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  84.17 
 
 		 684 bp  412  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  88.5 
 
 		 705 bp  404  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    85.44 
 
 		 503 bp  379  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    85.84 
 
 		 456 bp  369  1e-100  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    85.61 
 
 		 450 bp  357  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    81.82 
 
 		 754 bp  339  7e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    83.64 
 
 		 522 bp  293  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    86.72 
 
 		 309 bp  222  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  90.4 
 
 		 297 bp  208  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    83.44 
 
 		 337 bp  206  7e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    86.73 
 
 		 336 bp  180  4e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    85.42 
 
 		 716 bp  174  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  91.74 
 
 		 228 bp  161  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    86.42 
 
 		 189 bp  147  5e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  78.37 
 
 		 753 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  78.37 
 
 		 753 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    83.73 
 
 		 219 bp  129  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    87.29 
 
 		 135 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  89.32 
 
 		 162 bp  109  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  87.88 
 
 		 201 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    82.46 
 
 		 466 bp  101  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  85.34 
 
 		 228 bp  95.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  92.19 
 
 		 207 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    80.47 
 
 		 391 bp  85.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3951  hypothetical protein  90.91 
 
 		 111 bp  83.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    89.71 
 
 		 104 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  84 
 
 		 102 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8020  hypothetical protein  93.62 
 
 		 156 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256989  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    87.69 
 
 		 105 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    87.69 
 
 		 243 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  94.59 
 
 		 675 bp  58  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    86.44 
 
 		 201 bp  54  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  89.13 
 
 		 120 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 2832 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  89.13 
 
 		 120 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>