39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6183 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6183    100 
 
 		 337 bp  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    88.86 
 
 		 753 bp  353  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  89.52 
 
 		 753 bp  351  8e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  88.55 
 
 		 753 bp  345  5e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  87.95 
 
 		 753 bp  329  3e-88  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    88.57 
 
 		 753 bp  327  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  87.96 
 
 		 753 bp  321  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.12 
 
 		 1041 bp  321  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  88.12 
 
 		 753 bp  321  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.05 
 
 		 960 bp  309  3e-82  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    88.03 
 
 		 972 bp  307  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    87.66 
 
 		 752 bp  305  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    86.45 
 
 		 450 bp  289  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  86.65 
 
 		 753 bp  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    86.14 
 
 		 753 bp  281  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    86.42 
 
 		 503 bp  274  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    87.81 
 
 		 716 bp  272  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    86.02 
 
 		 752 bp  270  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    86.16 
 
 		 522 bp  270  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  84.64 
 
 		 753 bp  242  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  85 
 
 		 753 bp  242  5e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  84.78 
 
 		 753 bp  238  8e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  87.76 
 
 		 684 bp  236  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  84.16 
 
 		 741 bp  236  3e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    83.44 
 
 		 754 bp  206  3e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.54 
 
 		 754 bp  190  2e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  85.41 
 
 		 705 bp  188  7e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    82.8 
 
 		 699 bp  182  4e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    81.11 
 
 		 456 bp  145  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    90.48 
 
 		 189 bp  103  3e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  92.31 
 
 		 753 bp  89.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  92.31 
 
 		 753 bp  89.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    81.94 
 
 		 466 bp  81.8  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    84.51 
 
 		 391 bp  54  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    92.11 
 
 		 635 bp  52  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    93.75 
 
 		 748 bp  48.1  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    91.67 
 
 		 748 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  85.71 
 
 		 1041 bp  48.1  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    87.23 
 
 		 707 bp  46.1  0.006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>