66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4991 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  87.32 
 
 		 753 bp  724    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86.19 
 
 		 753 bp  660    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  86.85 
 
 		 753 bp  700    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    86.32 
 
 		 753 bp  668    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  89.38 
 
 		 753 bp  850    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    87.06 
 
 		 753 bp  678    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  85.98 
 
 		 741 bp  658    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    86.25 
 
 		 972 bp  646    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  87.78 
 
 		 753 bp  755    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  86.32 
 
 		 753 bp  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    95.36 
 
 		 754 bp  1201    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    100 
 
 		 752 bp  1491    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.83 
 
 		 960 bp  620  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    85.26 
 
 		 753 bp  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  85.13 
 
 		 753 bp  597  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  85.71 
 
 		 1041 bp  593  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    85.16 
 
 		 752 bp  581  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  84.51 
 
 		 753 bp  557  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    84.69 
 
 		 699 bp  529  1e-148  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  83.67 
 
 		 753 bp  502  1e-140  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  85.62 
 
 		 684 bp  496  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    88.01 
 
 		 503 bp  474  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  89.45 
 
 		 705 bp  448  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    87.47 
 
 		 450 bp  434  1e-119  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    82.71 
 
 		 754 bp  406  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    85.78 
 
 		 456 bp  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    86.21 
 
 		 522 bp  381  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    87.66 
 
 		 337 bp  305  1e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    86.78 
 
 		 716 bp  276  9e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  91.1 
 
 		 297 bp  244  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    86.61 
 
 		 309 bp  234  3e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    87.98 
 
 		 336 bp  214  3e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    89.51 
 
 		 189 bp  186  6e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    85.02 
 
 		 219 bp  165  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  91.74 
 
 		 228 bp  161  4e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  78.53 
 
 		 753 bp  159  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  78.53 
 
 		 753 bp  159  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    83.78 
 
 		 466 bp  129  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    87.29 
 
 		 135 bp  115  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  89.32 
 
 		 162 bp  109  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  87.88 
 
 		 201 bp  101  3e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    80.69 
 
 		 391 bp  97.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  85.34 
 
 		 228 bp  95.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    85.85 
 
 		 243 bp  91.7  3e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    85.71 
 
 		 105 bp  89.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  92.19 
 
 		 207 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3951  hypothetical protein  90.91 
 
 		 111 bp  83.8  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    84.31 
 
 		 635 bp  75.8  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    91.94 
 
 		 104 bp  75.8  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  84 
 
 		 102 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8020  hypothetical protein  93.62 
 
 		 156 bp  69.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    100 
 
 		 748 bp  63.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2215    92.5 
 
 		 174 bp  56  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.673879 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  94.44 
 
 		 675 bp  56  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    86.44 
 
 		 201 bp  54  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  88.24 
 
 		 780 bp  54  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 2832 bp  52  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  89.13 
 
 		 120 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  89.13 
 
 		 120 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    92.11 
 
 		 703 bp  52  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1884    85.25 
 
 		 168 bp  50.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4905  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.957848  normal  0.205167 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5322  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0019262  decreased coverage  0.00625276 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4964  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.075656  normal  0.378723 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4386  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.282162  normal  0.109494 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3403  AraC family transcriptional regulator  100 
 
 		 1035 bp  48.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.770334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>