32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0987 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_0987    100 
 
 
201 bp  398  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    85.6 
 
 
753 bp  105  5e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  90.36 
 
 
753 bp  101  7e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    82.32 
 
 
391 bp  95.6  4e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.31 
 
 
1041 bp  85.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  82.31 
 
 
753 bp  85.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  82.31 
 
 
960 bp  85.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    89.19 
 
 
754 bp  83.8  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    83.47 
 
 
753 bp  81.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  81.37 
 
 
753 bp  81.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  81.88 
 
 
753 bp  75.8  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    88.24 
 
 
503 bp  71.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  82.61 
 
 
753 bp  69.9  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  84.88 
 
 
753 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  84.04 
 
 
753 bp  67.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  81.82 
 
 
684 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5592  hypothetical protein  100 
 
 
498 bp  65.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.586213  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  86.57 
 
 
753 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  86.57 
 
 
705 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  81.98 
 
 
753 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    89.09 
 
 
753 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  88.14 
 
 
741 bp  61.9  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  81.36 
 
 
753 bp  60  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  81.36 
 
 
753 bp  60  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    82.95 
 
 
752 bp  56  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    86.44 
 
 
754 bp  54  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    86.44 
 
 
752 bp  54  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    79.45 
 
 
699 bp  52  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    84.06 
 
 
748 bp  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    91.67 
 
 
456 bp  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    93.55 
 
 
450 bp  46.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5828  Serine/threonine protein kinase-like protein  93.55 
 
 
1674 bp  46.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.636001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>