50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_2525 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  88.05 
 
 		 753 bp  735    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  86.84 
 
 		 753 bp  692    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    87.47 
 
 		 753 bp  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    100 
 
 		 753 bp  1493    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.38 
 
 		 753 bp  739    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  85.81 
 
 		 753 bp  630  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    85.56 
 
 		 972 bp  613  1e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    85.26 
 
 		 752 bp  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  87.79 
 
 		 684 bp  607  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  85.22 
 
 		 753 bp  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  85.11 
 
 		 741 bp  563  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    84.59 
 
 		 752 bp  555  1e-156  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  84.19 
 
 		 753 bp  539  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.05 
 
 		 960 bp  523  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  83.97 
 
 		 753 bp  523  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    83.92 
 
 		 753 bp  523  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  84.29 
 
 		 1041 bp  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  83.58 
 
 		 753 bp  509  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    82.78 
 
 		 754 bp  442  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    87.23 
 
 		 450 bp  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    81.92 
 
 		 699 bp  383  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    84.86 
 
 		 503 bp  385  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  80.95 
 
 		 753 bp  349  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    80.65 
 
 		 754 bp  307  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  85.55 
 
 		 705 bp  295  9e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    86.14 
 
 		 337 bp  281  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    83.38 
 
 		 522 bp  264  3e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    84.36 
 
 		 716 bp  228  2e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  80.46 
 
 		 753 bp  198  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  80.46 
 
 		 753 bp  198  2e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    84 
 
 		 309 bp  196  6e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    88.12 
 
 		 189 bp  167  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    79.32 
 
 		 456 bp  151  3e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  84.66 
 
 		 297 bp  145  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    82.38 
 
 		 336 bp  133  8.000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    82.93 
 
 		 466 bp  103  7e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    80 
 
 		 391 bp  93.7  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    80.85 
 
 		 219 bp  87.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    89.19 
 
 		 135 bp  83.8  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  83.62 
 
 		 228 bp  79.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  86.49 
 
 		 228 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    83.02 
 
 		 243 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    82.86 
 
 		 105 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  85.87 
 
 		 162 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    90 
 
 		 104 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    86.11 
 
 		 635 bp  63.9  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    89.09 
 
 		 201 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  84.15 
 
 		 201 bp  60  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  79.25 
 
 		 1041 bp  54  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    96.43 
 
 		 748 bp  48.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>