46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_6408 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_6408    100 
 
 		 309 bp  613  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  90.91 
 
 		 753 bp  347  1e-93  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  90.25 
 
 		 741 bp  335  4e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  89.17 
 
 		 753 bp  311  5.9999999999999995e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  89.09 
 
 		 753 bp  307  1.0000000000000001e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  88.36 
 
 		 753 bp  291  6e-77  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  88.09 
 
 		 960 bp  287  9e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    88.24 
 
 		 753 bp  285  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    89.92 
 
 		 336 bp  281  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  88.35 
 
 		 684 bp  281  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1878    87.73 
 
 		 972 bp  280  2e-73  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  87.64 
 
 		 753 bp  276  3e-72  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  87.5 
 
 		 753 bp  270  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    88.21 
 
 		 752 bp  268  8e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  87 
 
 		 753 bp  264  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87 
 
 		 1041 bp  264  1e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  86.55 
 
 		 753 bp  252  5e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  86.03 
 
 		 705 bp  238  7e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    86.61 
 
 		 752 bp  234  1e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  85.45 
 
 		 753 bp  228  7e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    86.72 
 
 		 754 bp  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    86.51 
 
 		 716 bp  222  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    87.38 
 
 		 699 bp  202  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    84 
 
 		 753 bp  196  3e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  86.7 
 
 		 297 bp  188  6e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.75 
 
 		 754 bp  186  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    85.65 
 
 		 391 bp  168  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    84.68 
 
 		 753 bp  163  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    91.53 
 
 		 135 bp  155  8.999999999999999e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  90.91 
 
 		 228 bp  153  3e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    83.56 
 
 		 219 bp  149  5e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  82.53 
 
 		 753 bp  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  82.53 
 
 		 753 bp  137  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  87.41 
 
 		 162 bp  125  8e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  87.61 
 
 		 228 bp  113  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  85.71 
 
 		 201 bp  95.6  7e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8020  hypothetical protein  93.62 
 
 		 156 bp  69.9  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256989  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    83.04 
 
 		 466 bp  69.9  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  89.66 
 
 		 225 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  86.49 
 
 		 207 bp  67.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3951  hypothetical protein  93.18 
 
 		 111 bp  63.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  82.95 
 
 		 102 bp  56  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  87.27 
 
 		 120 bp  54  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  85.71 
 
 		 240 bp  54  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  83.78 
 
 		 150 bp  52  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  88.64 
 
 		 120 bp  48.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>