64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1892 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_1878    86.95 
 
 
972 bp  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  87.87 
 
 
753 bp  733    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  87.07 
 
 
960 bp  694    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  89.54 
 
 
684 bp  656    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  85.94 
 
 
753 bp  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2525    87.47 
 
 
753 bp  710    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1892    100 
 
 
753 bp  1493    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  89.45 
 
 
753 bp  842    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  86.45 
 
 
741 bp  668    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  91.41 
 
 
753 bp  938    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4991    87.06 
 
 
752 bp  678    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  87.48 
 
 
753 bp  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  88.13 
 
 
753 bp  765    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  86 
 
 
753 bp  638    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8273    86.27 
 
 
753 bp  654    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.11171  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  85.91 
 
 
753 bp  622  1e-176  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  86.18 
 
 
1041 bp  613  1e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3376    85.56 
 
 
752 bp  591  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3932    85.79 
 
 
754 bp  587  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6405    90.32 
 
 
450 bp  539  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8427    89.38 
 
 
503 bp  507  1e-141  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.51552  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  83.33 
 
 
753 bp  480  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8695    83.42 
 
 
754 bp  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.221639  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7883    84.33 
 
 
699 bp  464  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.712837  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6183    88.86 
 
 
337 bp  353  5e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0824    85.43 
 
 
522 bp  329  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.799947  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8706    84.56 
 
 
456 bp  329  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.767164  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  88.29 
 
 
705 bp  315  1e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3233    87.01 
 
 
716 bp  293  4e-77  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  82 
 
 
753 bp  236  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  82 
 
 
753 bp  236  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  86.87 
 
 
297 bp  178  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0970    86.93 
 
 
466 bp  167  6e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6408    84.68 
 
 
309 bp  163  9e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3889    86.08 
 
 
189 bp  139  9.999999999999999e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333986  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2990    82.23 
 
 
336 bp  123  7.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8326    82.46 
 
 
219 bp  117  5e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2686    81.94 
 
 
391 bp  85.7  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7035    84.62 
 
 
135 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0950215  normal  0.0781378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0987    83.47 
 
 
201 bp  81.8  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.721005  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    82.14 
 
 
748 bp  79.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3350  putative transposase  89.23 
 
 
162 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  83.76 
 
 
228 bp  73.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  92.31 
 
 
225 bp  71.9  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  82.79 
 
 
228 bp  67.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2636    82.46 
 
 
635 bp  67.9  0.000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  81.97 
 
 
1041 bp  67.9  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8804    83.17 
 
 
243 bp  65.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6119    83 
 
 
105 bp  63.9  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  82.11 
 
 
201 bp  61.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8600  hypothetical protein  88.89 
 
 
120 bp  60  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.27479  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  85.94 
 
 
102 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3905  hypothetical protein  83.75 
 
 
150 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  89.58 
 
 
207 bp  56  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  94.44 
 
 
675 bp  56  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    94.29 
 
 
748 bp  54  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    94.29 
 
 
703 bp  54  0.00006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7493    82.76 
 
 
195 bp  54  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8390  hypothetical protein  92.11 
 
 
120 bp  52  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  80 
 
 
780 bp  50.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4993    85.94 
 
 
104 bp  48.1  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  83.82 
 
 
795 bp  48.1  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  83.82 
 
 
765 bp  48.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  83.82 
 
 
765 bp  48.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>