88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_6479 on replicon NC_010502
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010502  Mrad2831_6479  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  147  5e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5438  putative insertion sequence transposase-like protein  80 
 
 
250 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5422  putative insertion sequence transposase-like protein  80 
 
 
250 aa  90.5  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  65.45 
 
 
224 aa  81.6  0.000000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  61.82 
 
 
346 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6108  hypothetical protein  67.27 
 
 
250 aa  76.6  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1881  putative insertion sequence transposase-like protein  67.27 
 
 
246 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6131  Transposase and inactivated derivatives-like protein  67.27 
 
 
346 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1886  putative transposase  67.27 
 
 
250 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  59.32 
 
 
79 aa  75.1  0.0000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  59.26 
 
 
224 aa  74.3  0.0000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8531  hypothetical protein  66.04 
 
 
250 aa  74.3  0.0000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010373  M446_7034  hypothetical protein  67.92 
 
 
250 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0794917  normal  0.0905245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1866  putative insertion sequence transposase-like protein  67.92 
 
 
250 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.308333  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8630  Transposase and inactivated derivatives-like protein  65.45 
 
 
319 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6736  putative insertion sequence transposase-like protein  67.92 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0621826 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3886  putative insertion sequence transposase-like protein  67.92 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.829291  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5033  hypothetical protein  61.82 
 
 
250 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  57.41 
 
 
259 aa  70.5  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8409  hypothetical protein  66.04 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8268  hypothetical protein  64.71 
 
 
98 aa  67  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0489738  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7846  putative insertion sequence transposase-like protein  62.26 
 
 
234 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8317  hypothetical protein  58.82 
 
 
250 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324415  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0553  hypothetical protein  65 
 
 
75 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.152843  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8176  hypothetical protein  57.45 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.532624  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8340  hypothetical protein  63.41 
 
 
66 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6386  hypothetical protein  96.15 
 
 
160 aa  52  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1565  hypothetical protein  63.33 
 
 
79 aa  48.1  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.303831  normal  0.276056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  50 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  50 
 
 
254 aa  46.2  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  50 
 
 
264 aa  46.2  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  52.78 
 
 
238 aa  45.8  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  47.37 
 
 
218 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2566  putative transposase  51.35 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00978808  hitchhiker  0.00000650323 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2581  putative transposase  60.61 
 
 
33 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  44.74 
 
 
302 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  44.74 
 
 
235 aa  43.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  45.45 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4107  integrase  56.1 
 
 
236 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  56.1 
 
 
236 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.86 
 
 
222 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  57.5 
 
 
262 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  57.5 
 
 
237 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  48.65 
 
 
185 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  57.5 
 
 
211 aa  42  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  48.65 
 
 
181 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  44.44 
 
 
235 aa  42  0.003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  48.65 
 
 
185 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  44.74 
 
 
228 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  44.74 
 
 
228 aa  42  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  44.74 
 
 
228 aa  42  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  48.65 
 
 
206 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  50 
 
 
134 aa  41.2  0.005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4257  hypothetical protein  57.58 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1165  putative IS element transposase  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  44.44 
 
 
226 aa  41.2  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0077  IS6 family transposase  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.45392  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1696  IS6 family transposase  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1703  IS6 family transposase  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  55.26 
 
 
236 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  52.5 
 
 
237 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1705  IS6 family transposase  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2794  ISRh1 transposase-like protein  48.78 
 
 
242 aa  41.2  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  44.44 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  44.44 
 
 
235 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  47.22 
 
 
236 aa  40.4  0.007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  52.94 
 
 
230 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  52.94 
 
 
230 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.94 
 
 
230 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  52.94 
 
 
230 aa  40.4  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  50 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0209  hypothetical protein  41.67 
 
 
262 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  50 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  41.67 
 
 
235 aa  40.4  0.008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  50 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  50 
 
 
224 aa  40.4  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  41.67 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  50 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  41.67 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  50 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  50 
 
 
224 aa  40.4  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  41.67 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  41.67 
 
 
234 aa  40.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  50 
 
 
224 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  50 
 
 
224 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  50 
 
 
224 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  50 
 
 
224 aa  40  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0568  transposase  40.54 
 
 
122 aa  40  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.084687  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>