11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6484 on replicon NC_009622
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009622  Smed_6484    100 
 
 		 189 bp  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0121127  normal  0.519788 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0071  transposase  85.38 
 
 		 675 bp  107  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.507355 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4631  hypothetical protein  96.61 
 
 		 258 bp  101  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.764778 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8070  transposase  85.12 
 
 		 1041 bp  97.6  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.837659  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7154  transposase  84.87 
 
 		 675 bp  93.7  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2583  putative insertion sequence transposase-like protein  89.55 
 
 		 240 bp  77.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7012    87.84 
 
 		 748 bp  75.8  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3910    89.83 
 
 		 748 bp  69.9  0.0000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.570348  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3803  putative insertion sequence transposase-like protein  90.74 
 
 		 780 bp  67.9  0.0000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.6204 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3818    84.72 
 
 		 707 bp  56  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3813    91.67 
 
 		 703 bp  48.1  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.562408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>