More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7783 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011887  Mnod_7783  enolase  100 
 
 
426 aa  848    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.263643  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  53.19 
 
 
433 aa  401  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1162  enolase  49.28 
 
 
430 aa  392  1e-108  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.903735  normal  0.85465 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0004  phosphopyruvate hydratase  49.02 
 
 
422 aa  382  1e-105  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00896876  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5238  enolase  50.85 
 
 
425 aa  379  1e-104  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1452  phosphopyruvate hydratase  48.48 
 
 
430 aa  380  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.834453  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0210  phosphopyruvate hydratase  48.22 
 
 
430 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02281  phosphopyruvate hydratase  48.22 
 
 
430 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.879614  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  46.97 
 
 
428 aa  379  1e-104  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  49.27 
 
 
424 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0003  enolase  49.51 
 
 
422 aa  380  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00189223  normal  0.645027 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  48.56 
 
 
438 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  48.82 
 
 
428 aa  375  1e-103  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1575  phosphopyruvate hydratase  48.82 
 
 
433 aa  375  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.837756  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  46.93 
 
 
432 aa  378  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  47.07 
 
 
426 aa  377  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00171  phosphopyruvate hydratase  49.15 
 
 
430 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.305323  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02841  phosphopyruvate hydratase  48.82 
 
 
433 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  48.4 
 
 
437 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2755  enolase  55.29 
 
 
444 aa  375  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.44727 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02261  phosphopyruvate hydratase  47.74 
 
 
430 aa  374  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.65688  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0266  enolase  49.88 
 
 
428 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02371  phosphopyruvate hydratase  47.98 
 
 
430 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.532104  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  47.65 
 
 
434 aa  372  1e-102  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  47.54 
 
 
429 aa  372  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0146  phosphopyruvate hydratase  47.56 
 
 
428 aa  374  1e-102  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.152915  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  46.73 
 
 
427 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2015  enolase  45.5 
 
 
427 aa  369  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000117332  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0451  phosphopyruvate hydratase  48.19 
 
 
432 aa  370  1e-101  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1184  Phosphopyruvate hydratase  48.64 
 
 
426 aa  371  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  49.51 
 
 
427 aa  369  1e-101  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0639  phosphopyruvate hydratase  48.48 
 
 
430 aa  369  1e-101  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.397631  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1642  phosphopyruvate hydratase  49.52 
 
 
429 aa  371  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  48.77 
 
 
429 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  47.77 
 
 
427 aa  368  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  47.2 
 
 
423 aa  370  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  48.77 
 
 
429 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  47.22 
 
 
430 aa  369  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  47.65 
 
 
430 aa  369  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  48.77 
 
 
429 aa  369  1e-101  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2305  phosphopyruvate hydratase  49.05 
 
 
429 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  48.91 
 
 
429 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  46.35 
 
 
425 aa  366  1e-100  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  49.14 
 
 
427 aa  365  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  46.57 
 
 
431 aa  367  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1850  phosphopyruvate hydratase  48.54 
 
 
422 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0287956 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  47.22 
 
 
429 aa  367  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  47.16 
 
 
431 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0616  phosphopyruvate hydratase  47.9 
 
 
445 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.635755  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0568  phosphopyruvate hydratase  47.66 
 
 
430 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  45.99 
 
 
427 aa  367  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0701  phosphopyruvate hydratase  47.45 
 
 
431 aa  366  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.665549  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02271  phosphopyruvate hydratase  47.74 
 
 
432 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.260696  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_27721  phosphopyruvate hydratase  47.38 
 
 
431 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  49.15 
 
 
429 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2168  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.529059  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  47.22 
 
 
429 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2217  phosphopyruvate hydratase  48.57 
 
 
429 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2161  phosphopyruvate hydratase  48.93 
 
 
430 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.844141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  46.88 
 
 
438 aa  365  1e-99  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  365  1e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  46.94 
 
 
433 aa  365  1e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0768  enolase  47.46 
 
 
431 aa  365  1e-99  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0396287  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  364  1e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0920  enolase  50.74 
 
 
429 aa  364  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.208817  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  48.43 
 
 
428 aa  364  2e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  48.91 
 
 
427 aa  364  2e-99  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  48.81 
 
 
435 aa  363  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0744  enolase  48.18 
 
 
426 aa  364  2e-99  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.68227  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  48.67 
 
 
429 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2515  enolase  47.95 
 
 
427 aa  363  3e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  48.43 
 
 
428 aa  363  3e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  48.91 
 
 
429 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4373  enolase  46.49 
 
 
423 aa  363  3e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  46.42 
 
 
431 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  46.42 
 
 
431 aa  363  4e-99  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  47.3 
 
 
427 aa  363  4e-99  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0149  phosphopyruvate hydratase  47.61 
 
 
426 aa  362  5.0000000000000005e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.1066  normal  0.0543425 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  50.24 
 
 
439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45760  Enolase  50.24 
 
 
439 aa  363  5.0000000000000005e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.894682  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2015  phosphopyruvate hydratase  46.68 
 
 
422 aa  362  6e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0283  phosphopyruvate hydratase  45.93 
 
 
418 aa  362  7.0000000000000005e-99  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2020  phosphopyruvate hydratase  46.92 
 
 
422 aa  362  8e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  50.24 
 
 
438 aa  362  9e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1705  phosphopyruvate hydratase  45.97 
 
 
430 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  47.91 
 
 
424 aa  361  1e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  46.39 
 
 
438 aa  361  1e-98  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15790  enolase  45.81 
 
 
428 aa  361  1e-98  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000402486  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2476  phosphopyruvate hydratase  48.93 
 
 
430 aa  361  1e-98  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.846458  normal  0.0424446 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  47.77 
 
 
427 aa  361  1e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  47.41 
 
 
428 aa  361  1e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1687  phosphopyruvate hydratase  45.97 
 
 
430 aa  361  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1654  phosphopyruvate hydratase  48.28 
 
 
429 aa  361  1e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000730285  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0807  phosphopyruvate hydratase  50.12 
 
 
427 aa  361  2e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.180988  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  46.08 
 
 
430 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32250  enolase  48.9 
 
 
428 aa  360  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.236497 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0078  phosphopyruvate hydratase  47.33 
 
 
426 aa  361  2e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  unclonable  0.0000170876 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  48.02 
 
 
427 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>