More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_0283 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_0283  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 
418 aa  847    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0838  phosphopyruvate hydratase  62.65 
 
 
428 aa  520  1e-146  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000046981  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1562  enolase  60 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2195  enolase  58.68 
 
 
426 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000497652 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1310  phosphopyruvate hydratase  58.98 
 
 
429 aa  477  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  57.8 
 
 
427 aa  474  1e-133  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  58.35 
 
 
428 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  475  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  58.39 
 
 
427 aa  471  1e-132  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3222  phosphopyruvate hydratase  58.74 
 
 
430 aa  472  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0050  phosphopyruvate hydratase  59.32 
 
 
429 aa  472  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  58.5 
 
 
428 aa  473  1e-132  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5032  enolase  58.45 
 
 
426 aa  473  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4715  phosphopyruvate hydratase  59.12 
 
 
425 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000215444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2958  phosphopyruvate hydratase  58.39 
 
 
430 aa  473  1e-132  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000744717  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  471  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  60.1 
 
 
427 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2216  phosphopyruvate hydratase  58.78 
 
 
432 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  57.91 
 
 
429 aa  472  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0050  phosphopyruvate hydratase  59.32 
 
 
429 aa  471  1e-132  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1505  phosphopyruvate hydratase  58.88 
 
 
431 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.246827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1295  phosphopyruvate hydratase  58.88 
 
 
431 aa  472  1e-132  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000258447  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  58.92 
 
 
427 aa  473  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  58.68 
 
 
427 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  472  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1810  phosphopyruvate hydratase  58.05 
 
 
434 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  58.39 
 
 
427 aa  471  1.0000000000000001e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  57.42 
 
 
429 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  56.59 
 
 
433 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  57.84 
 
 
426 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0532  phosphopyruvate hydratase  57.84 
 
 
423 aa  469  1.0000000000000001e-131  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1070  phosphopyruvate hydratase  58.48 
 
 
433 aa  468  1.0000000000000001e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0757693 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3133  enolase  58.01 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00432064  normal  0.644199 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1402  enolase  57.28 
 
 
431 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0200  phosphopyruvate hydratase  57.21 
 
 
416 aa  470  1.0000000000000001e-131  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.969162  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  58.39 
 
 
427 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2659  phosphopyruvate hydratase  58.01 
 
 
437 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2093  phosphopyruvate hydratase  57.46 
 
 
416 aa  466  9.999999999999999e-131  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.470329  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3133  phosphopyruvate hydratase  58.15 
 
 
430 aa  468  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4067  enolase  58.47 
 
 
435 aa  466  9.999999999999999e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.122819  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0295  phosphopyruvate hydratase  57.52 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5238  enolase  58.82 
 
 
425 aa  467  9.999999999999999e-131  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2001  phosphopyruvate hydratase  57.46 
 
 
421 aa  467  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.000000000177738  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  58.19 
 
 
427 aa  466  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  58.78 
 
 
428 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3933  enolase  58.35 
 
 
426 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000019797  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0931  phosphopyruvate hydratase  58.05 
 
 
425 aa  466  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0406521  normal  0.0209015 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2847  enolase  57.11 
 
 
433 aa  464  1e-129  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.392404  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  58.01 
 
 
428 aa  463  1e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1322  phosphopyruvate hydratase  58.29 
 
 
428 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  57.42 
 
 
427 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0136  phosphopyruvate hydratase  57.14 
 
 
427 aa  463  1e-129  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0151  enolase  55.83 
 
 
427 aa  462  1e-129  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1780  phosphopyruvate hydratase  56.55 
 
 
429 aa  464  1e-129  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000860602  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3264  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 
429 aa  461  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2019  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 
431 aa  462  1e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00033595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1228  phosphopyruvate hydratase  58.39 
 
 
427 aa  464  1e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1424  phosphopyruvate hydratase  57.21 
 
 
424 aa  462  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0967  enolase  57.28 
 
 
432 aa  462  1e-129  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0306  phosphopyruvate hydratase  58.31 
 
 
427 aa  464  1e-129  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0996  phosphopyruvate hydratase  57.28 
 
 
429 aa  461  1e-129  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0889818  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0368  phosphopyruvate hydratase  59.23 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.891407  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1570  enolase  56.62 
 
 
427 aa  458  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2235  enolase  55.96 
 
 
423 aa  459  9.999999999999999e-129  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4824  phosphopyruvate hydratase  56.66 
 
 
431 aa  458  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.223702  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0003  enolase  56.8 
 
 
424 aa  460  9.999999999999999e-129  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0397743  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05865  enolase  57.21 
 
 
428 aa  459  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0428  phosphopyruvate hydratase  58.44 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0621  phosphopyruvate hydratase  59.12 
 
 
427 aa  459  9.999999999999999e-129  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.584957 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0174  phosphopyruvate hydratase  56.66 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.165268  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4619  phosphopyruvate hydratase  55.39 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.444953  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3678  phosphopyruvate hydratase  56.8 
 
 
430 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00320398  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1885  phosphopyruvate hydratase  58.92 
 
 
425 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96593  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1614  enolase  60.6 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4240  phosphopyruvate hydratase  55.39 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771117  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3143  phosphopyruvate hydratase  57.32 
 
 
424 aa  458  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.702195  normal  0.21693 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27220  Enolase  56.59 
 
 
437 aa  458  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382711  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4326  phosphopyruvate hydratase  55.39 
 
 
429 aa  458  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.47463 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1726  phosphopyruvate hydratase  56.76 
 
 
431 aa  461  9.999999999999999e-129  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000127224  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1147  phosphopyruvate hydratase  58.19 
 
 
426 aa  459  9.999999999999999e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0342675  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  57.07 
 
 
438 aa  461  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2603  enolase  57.45 
 
 
425 aa  461  9.999999999999999e-129  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5220  phosphopyruvate hydratase  56.66 
 
 
431 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1018  phosphopyruvate hydratase  56.1 
 
 
426 aa  455  1e-127  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.316109 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2483  phosphopyruvate hydratase  58.88 
 
 
430 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.700297  normal  0.330243 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  56.59 
 
 
439 aa  457  1e-127  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>