More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_1850 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012560  Avin_27220  Enolase  79.33 
 
 		 437 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382711  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22210  Enolase  78.61 
 
 		 437 aa  665    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  79.57 
 
 		 439 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45760  Enolase  79.57 
 
 		 439 aa  673    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.894682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1850  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 422 aa  860    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287956 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  79.33 
 
 		 438 aa  671    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  72.05 
 
 		 430 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  71.77 
 
 		 431 aa  605  9.999999999999999e-173  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  72.25 
 
 		 431 aa  596  1e-169  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  72.53 
 
 		 431 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  72.53 
 
 		 431 aa  587  1e-167  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  72.53 
 
 		 431 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  69.86 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  72.53 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  72.53 
 
 		 431 aa  587  1e-166  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  70.36 
 
 		 429 aa  585  1e-166  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1185  phosphopyruvate hydratase  70.36 
 
 		 431 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1196  phosphopyruvate hydratase  71.08 
 
 		 431 aa  582  1.0000000000000001e-165  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.061056  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  69.5 
 
 		 433 aa  583  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2757  phosphopyruvate hydratase  73.01 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.434874  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3350  phosphopyruvate hydratase  70.12 
 
 		 431 aa  578  1e-164  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000582829  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1115  phosphopyruvate hydratase  71.57 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00458035  normal  0.795235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1186  phosphopyruvate hydratase  71.57 
 
 		 431 aa  579  1e-164  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0854743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 429 aa  578  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  71.57 
 
 		 431 aa  580  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  68.43 
 
 		 427 aa  574  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1290  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 431 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000272056 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1205  phosphopyruvate hydratase  70.6 
 
 		 431 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000056862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  70.12 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  69.64 
 
 		 428 aa  570  1e-161  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3168  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00128116  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03083  phosphopyruvate hydratase  70.36 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00104366  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  568  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3085  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 432 aa  569  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000118024  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4106  phosphopyruvate hydratase  68.35 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3266  phosphopyruvate hydratase  68.99 
 
 		 432 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  0.113056 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0818  phosphopyruvate hydratase  68.75 
 
 		 432 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3233  phosphopyruvate hydratase  68.99 
 
 		 431 aa  567  1e-160  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0388546  normal  0.0683128 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  67.55 
 
 		 438 aa  564  1e-160  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0795  phosphopyruvate hydratase  69.71 
 
 		 431 aa  563  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.666938 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  67.31 
 
 		 438 aa  563  1.0000000000000001e-159  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0852  phosphopyruvate hydratase  68.51 
 
 		 432 aa  561  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3386  phosphopyruvate hydratase  68.99 
 
 		 431 aa  559  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0680089  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3033  phosphopyruvate hydratase  68.9 
 
 		 429 aa  559  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.427825  hitchhiker  0.00539461 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  67.4 
 
 		 438 aa  558  1e-158  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  67.64 
 
 		 428 aa  554  1e-157  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0979  phosphopyruvate hydratase  68.99 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3316  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.031619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1245  enolase  68.92 
 
 		 428 aa  556  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00208241  normal  0.787599 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3545  phosphopyruvate hydratase  68.75 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3446  phosphopyruvate hydratase  69.23 
 
 		 431 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528351  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.5 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.5 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.26 
 
 		 427 aa  551  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.5 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0561  phosphopyruvate hydratase  67.39 
 
 		 433 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.658237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.5 
 
 		 427 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.5 
 
 		 427 aa  552  1e-156  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03525  phosphopyruvate hydratase  68.82 
 
 		 433 aa  548  1e-155  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  65.54 
 
 		 427 aa  550  1e-155  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1260  enolase  64.08 
 
 		 426 aa  550  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002507  enolase  68.82 
 
 		 433 aa  550  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000898195  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.26 
 
 		 427 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  66.27 
 
 		 427 aa  551  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3440  enolase  73.23 
 
 		 398 aa  547  1e-154  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1689  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0511402  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2631  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  65.46 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1466  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3125  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.411097  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  65.46 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1052  phosphopyruvate hydratase  67.63 
 
 		 433 aa  544  1e-154  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.37483  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2193  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0564709  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2577  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 427 aa  547  1e-154  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  64.58 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  65.78 
 
 		 427 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  63.37 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1174  phosphopyruvate hydratase  63.37 
 
 		 427 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.538518 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2987  phosphopyruvate hydratase  66.02 
 
 		 428 aa  542  1e-153  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000287207  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1909  phosphopyruvate hydratase  65.05 
 
 		 427 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.48075  normal  0.540424 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>