More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1290 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_02624  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000285005  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0909  Phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000107152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38790  phosphopyruvate hydratase  77.62 
 
 		 429 aa  676    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1612  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 		 429 aa  676    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.553087 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1237  phosphopyruvate hydratase  90.49 
 
 		 431 aa  785    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00127737  hitchhiker  0.00000000142924 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3127  phosphopyruvate hydratase  90.49 
 
 		 431 aa  785    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172758  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2025  phosphopyruvate hydratase  77.6 
 
 		 433 aa  684    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000101898  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1504  phosphopyruvate hydratase  79.02 
 
 		 429 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4106  phosphopyruvate hydratase  77.55 
 
 		 432 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3440  enolase  90.2 
 
 		 398 aa  724    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1554  enolase  75.52 
 
 		 428 aa  650    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.384625  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0818  phosphopyruvate hydratase  76.85 
 
 		 432 aa  682    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.799798  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3350  phosphopyruvate hydratase  95.82 
 
 		 431 aa  837    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000582829  hitchhiker  0.0000028856 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0852  phosphopyruvate hydratase  76.85 
 
 		 432 aa  681    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1205  phosphopyruvate hydratase  93.04 
 
 		 431 aa  815    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000056862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1363  phosphopyruvate hydratase  75.52 
 
 		 428 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002507  enolase  75.29 
 
 		 433 aa  664    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000898195  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3136  phosphopyruvate hydratase  90.49 
 
 		 431 aa  785    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00228262  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2757  phosphopyruvate hydratase  90.26 
 
 		 431 aa  771    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.434874  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3149  phosphopyruvate hydratase  78.24 
 
 		 432 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00318163  normal  0.304263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1121  phosphopyruvate hydratase  77.62 
 
 		 429 aa  668    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.156527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3266  phosphopyruvate hydratase  78.01 
 
 		 432 aa  692    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.437484  normal  0.113056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3446  phosphopyruvate hydratase  76.8 
 
 		 431 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.528351  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2514  enolase  77.08 
 
 		 432 aa  670    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.267041  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03083  phosphopyruvate hydratase  78.37 
 
 		 430 aa  665    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00104366  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2923  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000182866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3033  phosphopyruvate hydratase  79.02 
 
 		 429 aa  671    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.427825  hitchhiker  0.00539461 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2917  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0019531  normal  0.702822 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1299  phosphopyruvate hydratase  78.75 
 
 		 433 aa  696    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3279  phosphopyruvate hydratase  90.49 
 
 		 431 aa  785    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.293287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1245  enolase  75.23 
 
 		 428 aa  634    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00208241  normal  0.787599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1166  phosphopyruvate hydratase  77.62 
 
 		 429 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.791434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3168  phosphopyruvate hydratase  78.24 
 
 		 432 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00128116  normal  0.40591 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1196  phosphopyruvate hydratase  88.86 
 
 		 431 aa  774    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.061056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1290  phosphopyruvate hydratase  100 
 
 		 431 aa  878    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000272056 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0619  enolase  73.95 
 
 		 431 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0795  phosphopyruvate hydratase  77.26 
 
 		 431 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.314685  normal  0.666938 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4165  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 		 429 aa  676    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.654872  normal  0.604317 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3085  phosphopyruvate hydratase  78.24 
 
 		 432 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000118024  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3266  phosphopyruvate hydratase  77.91 
 
 		 430 aa  681    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.399871  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3233  phosphopyruvate hydratase  78.42 
 
 		 431 aa  693    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0388546  normal  0.0683128 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03525  phosphopyruvate hydratase  74.83 
 
 		 433 aa  657    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3316  phosphopyruvate hydratase  76.8 
 
 		 431 aa  672    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.031619  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0561  phosphopyruvate hydratase  76.91 
 
 		 433 aa  681    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.658237  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02586  hypothetical protein  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000255384  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1115  phosphopyruvate hydratase  90.26 
 
 		 431 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00458035  normal  0.795235 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1186  phosphopyruvate hydratase  90.26 
 
 		 431 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0854743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0979  phosphopyruvate hydratase  76.57 
 
 		 431 aa  671    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.298831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1052  phosphopyruvate hydratase  80.79 
 
 		 433 aa  693    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.37483  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4039  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000102498  normal  0.767485 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17320  phosphopyruvate hydratase  79.02 
 
 		 429 aa  684    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1185  phosphopyruvate hydratase  92.34 
 
 		 431 aa  803    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3545  phosphopyruvate hydratase  77.73 
 
 		 431 aa  676    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3083  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215953  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3094  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269583  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1116  phosphopyruvate hydratase  90.49 
 
 		 431 aa  787    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.283596  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0933  phosphopyruvate hydratase  78.7 
 
 		 432 aa  698    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000829724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3110  phosphopyruvate hydratase  78.24 
 
 		 432 aa  693    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.151465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1036  phosphopyruvate hydratase  88.84 
 
 		 431 aa  771    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0669  phosphopyruvate hydratase  78.19 
 
 		 435 aa  642    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000208326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0921  phosphopyruvate hydratase  77.21 
 
 		 431 aa  654    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4063  phosphopyruvate hydratase  78.09 
 
 		 429 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000026158 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3386  phosphopyruvate hydratase  77.26 
 
 		 431 aa  673    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0680089  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0221  phosphopyruvate hydratase  69.28 
 
 		 433 aa  625  1e-178  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.713905  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22210  Enolase  70.93 
 
 		 437 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43350  Enolase  70.7 
 
 		 438 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0920843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45760  Enolase  70.93 
 
 		 439 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.894682  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49970  Enolase  70.93 
 
 		 439 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.917333  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27220  Enolase  70.7 
 
 		 437 aa  622  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.382711  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1664  phosphopyruvate hydratase  69.16 
 
 		 438 aa  597  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000737356  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1870  phosphopyruvate hydratase  68.84 
 
 		 438 aa  596  1e-169  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000338918  hitchhiker  0.000814995 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1636  phosphopyruvate hydratase  68.37 
 
 		 438 aa  594  1e-168  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000292411  hitchhiker  0.000813655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1129  phosphopyruvate hydratase  68.47 
 
 		 427 aa  585  1e-166  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.488598 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0972  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 		 427 aa  586  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0771581  normal  0.0192441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1068  phosphopyruvate hydratase  68.94 
 
 		 427 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.021025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1850  phosphopyruvate hydratase  69.64 
 
 		 422 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0287956 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0947  phosphopyruvate hydratase  68 
 
 		 428 aa  580  1e-164  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2364  phosphopyruvate hydratase  66.75 
 
 		 427 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.593258 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1091  phosphopyruvate hydratase  67.45 
 
 		 429 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.953298  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0897  phosphopyruvate hydratase  67.68 
 
 		 428 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2125  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0881955  normal  0.0226177 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1437  phosphopyruvate hydratase  66.36 
 
 		 428 aa  569  1e-161  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2017  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00385308 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2650  phosphopyruvate hydratase  64.71 
 
 		 427 aa  569  1e-161  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.828693  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1055  phosphopyruvate hydratase  66.04 
 
 		 429 aa  568  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5970  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2144  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2107  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  568  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1439  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.679392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5413  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.456423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3446  enolase  65.09 
 
 		 427 aa  567  1e-160  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0997  phosphopyruvate hydratase  64.55 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1894  phosphopyruvate hydratase  66.35 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3184  phosphopyruvate hydratase  65.41 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.147815  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1573  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.224968  normal  0.485305 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1183  phosphopyruvate hydratase  66.2 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2560  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  565  1e-160  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.178105  normal  0.251128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1163  phosphopyruvate hydratase  66.12 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000432295 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0912  phosphopyruvate hydratase  64.79 
 
 		 428 aa  567  1e-160  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2711  phosphopyruvate hydratase  65.88 
 
 		 427 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>