88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7658 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 75 aa  139  9e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 75 aa  139  9e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  93.75 
 
 		 75 aa  120  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  93.75 
 
 		 75 aa  120  5e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  92.19 
 
 		 75 aa  120  8e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  91.8 
 
 		 75 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  73.97 
 
 		 74 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  73.44 
 
 		 75 aa  94.7  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  71.88 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  71.88 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  73.77 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  73.77 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  73.77 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  72.13 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  72.41 
 
 		 76 aa  85.1  3e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  57.53 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.97 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  69.35 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  67.65 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  68.97 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  70.91 
 
 		 74 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  68.75 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  50 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  65.22 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  70.67 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  65.22 
 
 		 78 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  65.22 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.16 
 
 		 75 aa  68.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.58 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.64 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  42.47 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  64.71 
 
 		 74 aa  62  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  65.57 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  64.71 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  52.05 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  55.07 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  42.86 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 122 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 77 aa  47.4  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 321 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  39.71 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 81 aa  44.3  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  46.15 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.55 
 
 		 74 aa  43.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  33.85 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  48 
 
 		 77 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.3 
 
 		 69 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  39.13 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 78 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 75 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  38.24 
 
 		 104 aa  41.2  0.005  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 		 185 aa  40.4  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 96 aa  40  0.01  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 		 79 aa  40  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>