80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0079 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  100 
 
 
101 aa  192  1e-48  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  58.25 
 
 
104 aa  117  4.9999999999999996e-26  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  60.1  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  44.12 
 
 
109 aa  57.4  0.00000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  39.51 
 
 
321 aa  56.6  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  48.48 
 
 
90 aa  56.6  0.0000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
103 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
82 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
91 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
82 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 
91 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 
78 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 
70 aa  50.4  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 
185 aa  50.4  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
106 aa  50.1  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
90 aa  49.7  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  36.78 
 
 
122 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.81 
 
 
75 aa  49.3  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 
88 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
96 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  37.68 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 
91 aa  47.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2167  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
72 aa  47  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  44.9 
 
 
107 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  50.94 
 
 
82 aa  46.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  37.31 
 
 
74 aa  47  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40.54 
 
 
77 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  35.14 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 
101 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 
88 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  38.98 
 
 
96 aa  45.8  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 
109 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2457  F0F1 ATP synthase subunit C  44.29 
 
 
72 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 
81 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 
82 aa  45.4  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1278  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.453948  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  33.77 
 
 
93 aa  43.5  0.0009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1176  F0F1 ATP synthase subunit C  35.71 
 
 
85 aa  43.5  0.0009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.575473  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 
75 aa  42.7  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  40.58 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  46.51 
 
 
76 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
109 aa  42  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  30.67 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
78 aa  41.2  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 
81 aa  41.2  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  35.38 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  38.6 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  42.22 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 
77 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
93 aa  41.2  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  35.29 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 
73 aa  40.8  0.006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  32.91 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  33.33 
 
 
95 aa  40.8  0.007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  41.27 
 
 
73 aa  40.4  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 
92 aa  40.4  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
78 aa  40.4  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  36.92 
 
 
96 aa  40.4  0.009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 
74 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 
81 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
81 aa  40  0.01  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>