64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1892 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 
74 aa  137  6e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  52.05 
 
 
75 aa  78.2  0.00000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60.29 
 
 
77 aa  65.5  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  44.59 
 
 
74 aa  62.8  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  48.61 
 
 
75 aa  61.2  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  45.31 
 
 
75 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  45.31 
 
 
75 aa  57.8  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  45.31 
 
 
75 aa  57.8  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  42.65 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
75 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
75 aa  56.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  36.49 
 
 
75 aa  54.7  0.0000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 
76 aa  54.3  0.0000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.31 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.31 
 
 
75 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.66 
 
 
74 aa  53.9  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.75 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.54 
 
 
76 aa  53.9  0.0000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.75 
 
 
75 aa  53.9  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  36.99 
 
 
75 aa  50.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 
83 aa  50.8  0.000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 
92 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.59 
 
 
74 aa  47.8  0.00006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  36.76 
 
 
104 aa  47.4  0.00007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.3 
 
 
69 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.89 
 
 
75 aa  46.2  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 
321 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
91 aa  44.3  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
91 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.71 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
91 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  42.86 
 
 
71 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01624  ATP synthase subunit 9, mitochondrial Precursor (Lipid-binding protein) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P16000]  38.3 
 
 
143 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.460888 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  45.21 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 
91 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  36.23 
 
 
96 aa  42.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 
91 aa  42.7  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
77 aa  42.4  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 
91 aa  42  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  33.33 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
88 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 
107 aa  42  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  35.29 
 
 
101 aa  40.8  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.95 
 
 
75 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  40.74 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
111 aa  40.8  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
122 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  45.31 
 
 
75 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.67 
 
 
77 aa  40  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>