71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4017 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 77 aa  149  1e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  70.13 
 
 		 80 aa  88.2  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  60.27 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  60.56 
 
 		 74 aa  83.6  8e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  62.32 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  59.09 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.35 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.32 
 
 		 74 aa  72  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  55.22 
 
 		 67 aa  72.8  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.76 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  55.74 
 
 		 81 aa  68.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  43.42 
 
 		 76 aa  66.6  0.0000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  48.61 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50.7 
 
 		 76 aa  65.5  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.61 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  43.66 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.29 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 73 aa  61.6  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  58.21 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.09 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  56.72 
 
 		 74 aa  53.5  0.0000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  53.33 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  47.14 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  38.1 
 
 		 77 aa  50.1  0.000009  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 		 70 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 92 aa  48.5  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.07 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 79 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.77 
 
 		 75 aa  47  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  37.7 
 
 		 76 aa  45.4  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 77 aa  45.8  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 73 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.05 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 78 aa  43.9  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.0009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 73 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  35.94 
 
 		 93 aa  42  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  38.6 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  37.1 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  38.78 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  38 
 
 		 77 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 78 aa  40.4  0.008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.67 
 
 		 74 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  30.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  30.67 
 
 		 100 aa  40.4  0.009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.31 
 
 		 74 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 		 78 aa  40  0.01  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>