75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0555 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 75 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  140  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  140  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  82.19 
 
 		 74 aa  120  4e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  98.36 
 
 		 75 aa  118  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  98.36 
 
 		 75 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  98.36 
 
 		 75 aa  118  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  96.72 
 
 		 75 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  98.25 
 
 		 76 aa  110  6e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  73.44 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  73.44 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  73.44 
 
 		 75 aa  94.4  5e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.88 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.88 
 
 		 75 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  81.25 
 
 		 75 aa  92.4  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 		 75 aa  86.7  9e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  70.69 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60.27 
 
 		 76 aa  84.7  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60.56 
 
 		 74 aa  82.4  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.52 
 
 		 75 aa  78.6  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  67.24 
 
 		 77 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  61.64 
 
 		 75 aa  76.6  0.00000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  62.67 
 
 		 74 aa  77  0.00000000000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  74.67 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  52.7 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  58.9 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  58.9 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  47.95 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.16 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.33 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  59.42 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  45.21 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  60.78 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  60.78 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.38 
 
 		 77 aa  55.5  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  43.1 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  38.57 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  39.13 
 
 		 101 aa  45.4  0.0003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 81 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  35.71 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 		 77 aa  43.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 321 aa  42.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  38.46 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  39.68 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  35.59 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  35.14 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  35.14 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  29.85 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  35.14 
 
 		 76 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 82 aa  40.8  0.006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.81 
 
 		 69 aa  40.8  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  40.4  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  38.1 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 111 aa  40  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>