52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1317 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  100 
 
 		 75 aa  137  7e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  84 
 
 		 75 aa  102  1e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  59.46 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.11 
 
 		 76 aa  79  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  63.08 
 
 		 74 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  83.78 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.9 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  71.6  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  59.02 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  59.02 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  59.02 
 
 		 75 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  53.12 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  53.12 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  57.38 
 
 		 75 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.67 
 
 		 75 aa  63.5  0.0000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  63.5  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  59.65 
 
 		 76 aa  63.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  56.34 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  56.34 
 
 		 78 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  58.18 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.46 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  44 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  58.62 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  56.72 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  42.67 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  59.18 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  56.16 
 
 		 74 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  51.56 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  38.24 
 
 		 90 aa  48.5  0.00003  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  32.43 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  38.81 
 
 		 69 aa  42.7  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 96 aa  42  0.003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 75 aa  42  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  36.21 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  36.21 
 
 		 73 aa  41.2  0.005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 74 aa  40.4  0.008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 71 aa  40.4  0.008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>