111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2878 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 77 aa  143  9e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  83.82 
 
 		 74 aa  103  9e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  76 
 
 		 78 aa  90.9  6e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  70.15 
 
 		 74 aa  90.5  7e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  68 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  68 
 
 		 78 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  71.83 
 
 		 71 aa  86.7  9e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  88.24 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.97 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.97 
 
 		 75 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  67.24 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  65.52 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  65.52 
 
 		 75 aa  77  0.00000000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60 
 
 		 74 aa  76.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  63.79 
 
 		 75 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  65.52 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  65.52 
 
 		 75 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.21 
 
 		 76 aa  74.7  0.0000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 		 75 aa  72.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  67.27 
 
 		 76 aa  72  0.000000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  66.67 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  70.9  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60.34 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  63.64 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  46.27 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.59 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.72 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.69 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.27 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  62.32 
 
 		 75 aa  52.8  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.54 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  38.98 
 
 		 95 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  35.38 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 73 aa  47.8  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 		 83 aa  47.8  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  37.29 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 83 aa  47.4  0.00007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  36.23 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  58.82 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  37.31 
 
 		 93 aa  47  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 		 73 aa  46.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  37.29 
 
 		 93 aa  45.4  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  37.31 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  40.3 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  38.98 
 
 		 91 aa  45.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  37.29 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  38.6 
 
 		 91 aa  45.1  0.0004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 91 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  39.73 
 
 		 103 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  30.43 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 321 aa  44.7  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 122 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  32.84 
 
 		 74 aa  43.9  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  36.21 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  32.2 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  36.21 
 
 		 93 aa  43.5  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  35.06 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  36.21 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  42.31 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  36 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 74 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  47.5 
 
 		 96 aa  42  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  60 
 
 		 75 aa  41.6  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 		 82 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  39.71 
 
 		 94 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  33.77 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 111 aa  41.2  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  47.5 
 
 		 107 aa  41.2  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>