53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0268 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 75 aa  139  9e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  98.67 
 
 		 75 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  79.45 
 
 		 74 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  70.31 
 
 		 75 aa  90.1  9e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  92 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.19 
 
 		 75 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.19 
 
 		 75 aa  88.6  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  68.75 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  68.75 
 
 		 75 aa  88.2  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.19 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  67.19 
 
 		 75 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  65.62 
 
 		 75 aa  87  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.67 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  70.49 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  68.85 
 
 		 75 aa  84  6e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  81.25 
 
 		 75 aa  83.2  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  70.69 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  74.55 
 
 		 74 aa  78.6  0.00000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.9 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  57.75 
 
 		 74 aa  73.9  0.0000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  62.07 
 
 		 77 aa  69.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  58.82 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  68.12 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  68.12 
 
 		 78 aa  68.2  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  68.12 
 
 		 71 aa  67.8  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  61.33 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.05 
 
 		 75 aa  67.4  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.79 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.32 
 
 		 74 aa  64.7  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  60.78 
 
 		 74 aa  57.8  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  60.78 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  49.32 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  47.89 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 75 aa  50.8  0.000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  38.67 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  35.82 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  40.58 
 
 		 101 aa  47  0.0001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  42.03 
 
 		 83 aa  46.2  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  44.29 
 
 		 77 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  53.33 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 96 aa  44.7  0.0004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 		 77 aa  42.7  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 74 aa  41.2  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 81 aa  41.6  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  35.14 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>