95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3635 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 74 aa  140  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  71.62 
 
 		 75 aa  93.6  9e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  60 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60.56 
 
 		 77 aa  83.6  8e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  59.15 
 
 		 76 aa  81.3  0.000000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  59.7 
 
 		 69 aa  80.1  0.000000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  60 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  58.82 
 
 		 68 aa  77  0.00000000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  56.76 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  58.46 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  60.32 
 
 		 73 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  61.67 
 
 		 81 aa  72.8  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52.31 
 
 		 82 aa  67.8  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  49.32 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  53.42 
 
 		 74 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  57.33 
 
 		 80 aa  65.9  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  42.67 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  49.23 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1265  ATP synthase F0, C subunit  57.97 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.126643 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  46.77 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  50.94 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.35 
 
 		 72 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  53.85 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.67 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  58.21 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  58.11 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  45 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  57.14 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3712  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.55 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  33.87 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  43.86 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 79 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  32.79 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 76 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  38.6 
 
 		 78 aa  46.2  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  41.38 
 
 		 70 aa  45.1  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 73 aa  45.1  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  41.82 
 
 		 92 aa  45.1  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 75 aa  43.9  0.0008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  35 
 
 		 81 aa  43.5  0.0009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  40.82 
 
 		 75 aa  43.1  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  40 
 
 		 70 aa  43.5  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  43.55 
 
 		 65 aa  42.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.64 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  38.98 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1800  ATP synthase F0, C subunit  57.41 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.217172  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  31.67 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  31.67 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  41.2  0.004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  38.3 
 
 		 70 aa  40.4  0.007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  30 
 
 		 91 aa  40  0.01  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>