195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_0312 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 75 aa  137  3.9999999999999997e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  73.33 
 
 		 79 aa  103  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  70.27 
 
 		 76 aa  100  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  68.92 
 
 		 76 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  68.92 
 
 		 76 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  71.83 
 
 		 78 aa  97.4  5e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  74.29 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  75.71 
 
 		 73 aa  96.3  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  65.33 
 
 		 78 aa  90.1  8e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  75.41 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  75.41 
 
 		 75 aa  85.5  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  78.57 
 
 		 75 aa  84.7  4e-16  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  67.19 
 
 		 81 aa  83.6  8e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  66.1 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  64.41 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  65.57 
 
 		 70 aa  74.3  0.0000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  63.27 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.14 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  64.58 
 
 		 73 aa  62  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  67.39 
 
 		 85 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  72.09 
 
 		 93 aa  57  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 96 aa  56.6  0.0000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  46.03 
 
 		 78 aa  55.5  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 91 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 82 aa  56.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  48.61 
 
 		 76 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 		 81 aa  55.1  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 321 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 		 73 aa  54.7  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 91 aa  55.1  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 		 76 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 77 aa  54.3  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  65 
 
 		 66 aa  53.9  0.0000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 81 aa  52.8  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  51.02 
 
 		 77 aa  52.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40.28 
 
 		 91 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 		 68 aa  52.4  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  40.85 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 100 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 82 aa  52.4  0.000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 72 aa  52.8  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  38.89 
 
 		 91 aa  51.6  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 72 aa  52  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 75 aa  51.2  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  41.79 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  36.84 
 
 		 78 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 		 82 aa  49.7  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.4 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  44 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 76 aa  48.9  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  44.29 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  41.54 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  39.39 
 
 		 70 aa  47.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  41.51 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>