126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1230 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
93 aa  160  5.0000000000000005e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  66.1 
 
 
81 aa  76.6  0.0000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  63.77 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 
73 aa  75.1  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  62.86 
 
 
73 aa  74.3  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  65 
 
 
70 aa  74.3  0.0000000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  66.13 
 
 
75 aa  73.2  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  65 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  65 
 
 
75 aa  70.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  55.07 
 
 
78 aa  68.2  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  60 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 
76 aa  66.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 
76 aa  64.3  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 
79 aa  63.9  0.0000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  37.63 
 
 
92 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  51.72 
 
 
75 aa  60.1  0.00000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.39 
 
 
65 aa  58.2  0.00000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  60.87 
 
 
79 aa  57.8  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  48.33 
 
 
73 aa  56.6  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  45.33 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.72 
 
 
74 aa  55.5  0.0000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 
76 aa  54.3  0.0000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 
73 aa  54.3  0.0000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
74 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  39.44 
 
 
96 aa  52.4  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.67 
 
 
78 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  58.54 
 
 
66 aa  51.2  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  42.62 
 
 
74 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 
77 aa  50.8  0.000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 
73 aa  50.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
81 aa  49.7  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  38.16 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  38.67 
 
 
111 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  45.76 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 
76 aa  48.5  0.00003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  56.82 
 
 
85 aa  47.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 
79 aa  47.8  0.00006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
74 aa  47.4  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  41.07 
 
 
122 aa  47  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.62 
 
 
75 aa  47  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  43.84 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 
76 aa  45.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  45.4  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
81 aa  45.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  45.1 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  48.21 
 
 
70 aa  45.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03045  hypothetical protein  52.5 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  37.25 
 
 
85 aa  44.7  0.0005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 
77 aa  44.3  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  43.75 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  34.12 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  45.1 
 
 
81 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 
81 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 
82 aa  43.9  0.0008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 
81 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  40.38 
 
 
81 aa  43.5  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.44 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  36.9 
 
 
109 aa  43.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  50.82 
 
 
77 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  54.39 
 
 
73 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0367  ATP synthase F0, C subunit  37.78 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 
81 aa  42.4  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  32.94 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52210  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
78 aa  42.7  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 
77 aa  42  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  37.1 
 
 
91 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  39.58 
 
 
81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 
77 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  41.38 
 
 
76 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  39.58 
 
 
81 aa  42  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  37.25 
 
 
81 aa  41.6  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  37.29 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  42.11 
 
 
82 aa  41.2  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  35.94 
 
 
321 aa  41.6  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>