249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1243 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
85 aa  165  2e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  57.58 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  57.58 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  57.58 
 
 
70 aa  80.9  0.000000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  54.29 
 
 
72 aa  80.1  0.000000000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  56.92 
 
 
79 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  47.89 
 
 
77 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  52.46 
 
 
81 aa  67.8  0.00000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  59.42 
 
 
72 aa  67.4  0.00000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  59.57 
 
 
70 aa  67  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
76 aa  67  0.00000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  48.53 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  54.1 
 
 
78 aa  65.1  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0462  ATP synthase F0, C subunit  66.67 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00357731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  62.4  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 
77 aa  62.4  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4796  ATP synthase F0, C subunit  75.68 
 
 
76 aa  62  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000270119  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  43.66 
 
 
75 aa  62  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 
74 aa  62  0.000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 
76 aa  60.5  0.000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0078  ATP synthase F0, C subunit  51.02 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 
78 aa  59.3  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  44.59 
 
 
78 aa  58.5  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3971  F0F1 ATP synthase subunit C  41.43 
 
 
81 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000527403  normal  0.270101 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 
78 aa  56.6  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
79 aa  56.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 
75 aa  55.8  0.0000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2802  F0F1 ATP synthase subunit C  43.28 
 
 
79 aa  55.5  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0121478  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  36.62 
 
 
91 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  42.65 
 
 
73 aa  55.5  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  36.99 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2762  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 
91 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  36.99 
 
 
91 aa  55.1  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  36.62 
 
 
91 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  45.9 
 
 
70 aa  54.3  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  38.57 
 
 
77 aa  53.9  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 
85 aa  53.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  38.96 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 
73 aa  53.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  43.06 
 
 
84 aa  52  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 
73 aa  52.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 
84 aa  52  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
82 aa  52  0.000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  43.06 
 
 
85 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3208  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.021594  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
82 aa  52  0.000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2812  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 
84 aa  51.6  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0167468  normal  0.260014 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  32.88 
 
 
91 aa  51.6  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  36.71 
 
 
103 aa  51.6  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
81 aa  51.2  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  37.88 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  39.19 
 
 
82 aa  50.8  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2170  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
94 aa  50.8  0.000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000156588  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  43.33 
 
 
81 aa  50.4  0.000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
111 aa  50.4  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
81 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 
83 aa  50.4  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2330  ATP synthase F0, C subunit  46.55 
 
 
95 aa  50.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000022409  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  32.39 
 
 
91 aa  49.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4050  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 
88 aa  50.1  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 
75 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  40.28 
 
 
83 aa  50.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4752  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  36.71 
 
 
86 aa  48.9  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4315  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0295154  hitchhiker  0.0000000000618272 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4370  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00324113  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  32.35 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3757  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00912084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4022  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0586605  normal  0.864238 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4135  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000070467  hitchhiker  0.00469633 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4512  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00265019  normal  0.0246205 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  34.85 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4371  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
83 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000250209  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.62 
 
 
75 aa  48.9  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  37.66 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>