224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0393 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 70 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  69.49 
 
 		 81 aa  78.6  0.00000000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 		 78 aa  78.6  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  70.49 
 
 		 73 aa  77.8  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 76 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  62.9 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 79 aa  76.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  70.18 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  70.18 
 
 		 75 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  65.57 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  72.55 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2097  ATP synthase F0, C subunit  67.92 
 
 		 75 aa  69.3  0.00000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.887502  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  64.71 
 
 		 73 aa  66.6  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0180  ATP synthase, subunit C (H(+)-transporting two-sector ATPase)  71.74 
 
 		 79 aa  65.5  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.51432  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  68 
 
 		 75 aa  63.9  0.0000000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  55.38 
 
 		 68 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.48 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3215  ATP synthase F0, C subunit  70.45 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.112485 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  53.12 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1717  ATP synthase F0, C subunit  77.5 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000377801  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  48.44 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  53.12 
 
 		 75 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50.77 
 
 		 76 aa  59.3  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 73 aa  58.2  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 89 aa  57.4  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  50.82 
 
 		 79 aa  57  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1230  ATP synthase F0, C subunit  61.36 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  49.23 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  55.36 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0111  F0F1 ATP synthase subunit C  53.57 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00023938  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 72 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  46.03 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  50.91 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2523  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 85 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000405757  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.94 
 
 		 74 aa  52.8  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  50.98 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  48.21 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  49.12 
 
 		 76 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 85 aa  52  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  50.98 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 74 aa  52  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  49.02 
 
 		 81 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  51.6  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  47.54 
 
 		 91 aa  51.2  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  50.8  0.000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 111 aa  50.4  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  43.55 
 
 		 90 aa  50.4  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  43.28 
 
 		 101 aa  50.4  0.000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  46.67 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4245  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000128569  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  36.51 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  45.9 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  44.26 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  51.61 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3899  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3850  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0401321  hitchhiker  0.0000255174 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0035  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00371718  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3930  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0039435  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4491  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000555437  hitchhiker  0.0000047604 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4903  F0F1 ATP synthase subunit C  44.83 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000000864371  normal  0.254622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>