186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2453 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 
76 aa  144  3e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  81.82 
 
 
77 aa  121  3e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  82.89 
 
 
78 aa  121  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  80.88 
 
 
81 aa  111  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  74.65 
 
 
73 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  74.32 
 
 
74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  62.67 
 
 
75 aa  100  7e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  64.86 
 
 
75 aa  99  2e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.79 
 
 
74 aa  82  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  50.65 
 
 
81 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  52.86 
 
 
75 aa  74.7  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 
76 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  48.57 
 
 
77 aa  72.8  0.000000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  46.58 
 
 
76 aa  70.5  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  49.32 
 
 
74 aa  67.8  0.00000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.25 
 
 
82 aa  67.4  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.42 
 
 
77 aa  66.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  43.94 
 
 
69 aa  64.7  0.0000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 
68 aa  63.9  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  48.33 
 
 
72 aa  62.8  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  47.76 
 
 
71 aa  61.2  0.000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
70 aa  61.6  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  45.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  55.84 
 
 
77 aa  60.1  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  53.23 
 
 
75 aa  58.2  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  47.89 
 
 
122 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 
70 aa  57  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 
79 aa  56.6  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
81 aa  56.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  55.07 
 
 
73 aa  55.5  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
81 aa  55.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  53.19 
 
 
85 aa  55.8  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
81 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 
82 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 
92 aa  55.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.35 
 
 
80 aa  55.1  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 
75 aa  53.9  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  51.79 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
82 aa  53.5  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  46.81 
 
 
70 aa  53.5  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  46.48 
 
 
111 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 
81 aa  52.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  38.81 
 
 
70 aa  52.8  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  45.65 
 
 
72 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.55 
 
 
72 aa  52  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 
81 aa  52  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  52.08 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  57.45 
 
 
82 aa  51.6  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  57.45 
 
 
81 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 
82 aa  51.2  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
77 aa  50.4  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
91 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 
79 aa  50.4  0.000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  45 
 
 
78 aa  50.1  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
65 aa  50.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  49.25 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  38.6 
 
 
77 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 
91 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
73 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
73 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  44.64 
 
 
91 aa  48.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
77 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 
78 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 
85 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  36.84 
 
 
76 aa  47.4  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
76 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 
76 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 
83 aa  47  0.00009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  30.99 
 
 
103 aa  47  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  42.37 
 
 
76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
66 aa  46.2  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  40.82 
 
 
91 aa  46.6  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002025  ATP synthase C chain  40.85 
 
 
84 aa  47  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000213686  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  42.55 
 
 
71 aa  46.6  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 
75 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00427  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 
84 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>