162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0533 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 76 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 76 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 76 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  52.7 
 
 		 77 aa  77  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  52.94 
 
 		 122 aa  68.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  52.94 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  52.94 
 
 		 82 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  52.94 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  51.47 
 
 		 81 aa  67  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  52.94 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  47.95 
 
 		 321 aa  63.2  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  54.93 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  55.41 
 
 		 77 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  62.26 
 
 		 77 aa  62.8  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  50 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  43.24 
 
 		 91 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44.78 
 
 		 91 aa  59.3  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  41.89 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 91 aa  57  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  43.28 
 
 		 91 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 81 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  49.09 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 91 aa  54.7  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  43.06 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  40 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 88 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  42.11 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  50.91 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  53.62 
 
 		 76 aa  51.2  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  47.27 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.35 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  36.23 
 
 		 93 aa  50.4  0.000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  36.23 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  50.4  0.000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  37.14 
 
 		 95 aa  50.1  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  37.14 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 90 aa  50.1  0.00001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  48.15 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  39.44 
 
 		 82 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  32.86 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  48.08 
 
 		 101 aa  47.4  0.00006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  39.71 
 
 		 70 aa  47.8  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 79 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  39.44 
 
 		 90 aa  47.4  0.00006  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0330  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1688  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.89 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.422777 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 76 aa  47  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 73 aa  47  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  40.98 
 
 		 79 aa  46.2  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  31.43 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 73 aa  45.8  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  34.29 
 
 		 93 aa  45.1  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 		 75 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  36.62 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  35.53 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 96 aa  45.4  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  52.17 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  33.78 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  41.94 
 
 		 606 aa  45.1  0.0004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  42.11 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  40.35 
 
 		 91 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 94 aa  44.7  0.0005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1014  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.28 
 
 		 142 aa  44.7  0.0005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  30 
 
 		 93 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  40.35 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.45 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  36.99 
 
 		 76 aa  44.3  0.0006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  35.94 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  37.7 
 
 		 81 aa  43.9  0.0008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  37.88 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  37.88 
 
 		 100 aa  43.5  0.0009  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>