215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1779 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 77 aa  146  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  92.11 
 
 		 78 aa  134  5e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  81.82 
 
 		 76 aa  121  3e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  70.89 
 
 		 81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  74.29 
 
 		 74 aa  103  8e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  66.2 
 
 		 73 aa  99.4  2e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  67.14 
 
 		 75 aa  96.7  1e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  61.64 
 
 		 75 aa  95.9  1e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  55.26 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  51.39 
 
 		 74 aa  75.5  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  45.83 
 
 		 77 aa  74.7  0.0000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  51.43 
 
 		 75 aa  72  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  52.17 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  52.31 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 72 aa  65.5  0.0000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  50.75 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  43.66 
 
 		 77 aa  63.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  47.69 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  52.46 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 70 aa  60.8  0.000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18250  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  41.79 
 
 		 67 aa  59.7  0.00000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.447558  normal  0.275896 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.3 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1040  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0572773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.07 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 		 79 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  41.79 
 
 		 71 aa  57  0.00000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1311  H+transporting two-sector ATPase C subunit  49.35 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.391877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3308  F0F1 ATP synthase subunit C  53.19 
 
 		 70 aa  56.2  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866069  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1243  F0F1 ATP synthase subunit C  57.45 
 
 		 85 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.290322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3420  F0F1 ATP synthase subunit C  52.17 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  47.46 
 
 		 74 aa  54.3  0.0000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  43.66 
 
 		 111 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  40.68 
 
 		 92 aa  53.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  47.54 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 91 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  43.64 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 		 78 aa  52.4  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  49.09 
 
 		 91 aa  52.4  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  40.85 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3921  ATP synthase F0, C subunit  50.72 
 
 		 73 aa  52  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 73 aa  51.2  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  45.1 
 
 		 65 aa  51.2  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 73 aa  51.6  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  45.61 
 
 		 91 aa  51.6  0.000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  47.27 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  46 
 
 		 77 aa  51.2  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  50.8  0.000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1666  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  48.68 
 
 		 77 aa  50.8  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 76 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4300  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  50.4  0.000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00293753  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  50.4  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  52 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  32.89 
 
 		 93 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  52 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0057  F0F1 ATP synthase subunit C  48.15 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04088  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0194198  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  35.85 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2343  H+transporting two-sector ATPase C subunit  46.97 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000577712 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2610  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.27 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.258859  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 		 88 aa  47.8  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  29.33 
 
 		 93 aa  47.8  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  47.92 
 
 		 81 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3064  F0F1 ATP synthase subunit C  40.79 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>