184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1270 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 77 aa  144  5e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  93.51 
 
 		 77 aa  121  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  52.7 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  52.7 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  52.7 
 
 		 76 aa  77  0.00000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  55.38 
 
 		 103 aa  73.6  0.0000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0990  ATP synthase F0, C subunit  67.61 
 
 		 76 aa  70.9  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.447801  normal  0.601286 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  62.26 
 
 		 77 aa  70.9  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 		 122 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 82 aa  67.4  0.00000000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  49.25 
 
 		 111 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  48.53 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 		 96 aa  63.5  0.0000000009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  48.57 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  47.14 
 
 		 72 aa  61.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3635  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 		 74 aa  60.8  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.89 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  44.93 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  43.55 
 
 		 75 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 		 79 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4141  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  44.83 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 		 70 aa  57.4  0.00000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 76 aa  57  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  40.54 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2121  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 76 aa  57  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000306231  hitchhiker  0.00429019 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  45.21 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 91 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  44.16 
 
 		 83 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 82 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  46.3 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0895  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48.21 
 
 		 74 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1019  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.76 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.212732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 75 aa  54.3  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  45.07 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 91 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 		 91 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  40.98 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 76 aa  52.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.61 
 
 		 69 aa  52.4  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  42.59 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  33.33 
 
 		 92 aa  51.6  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  33.82 
 
 		 95 aa  52  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  34.67 
 
 		 79 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 104 aa  51.2  0.000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4017  H+transporting two-sector ATPase C subunit  41.18 
 
 		 77 aa  51.6  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000406172 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  37.31 
 
 		 70 aa  51.2  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  39.34 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  36 
 
 		 78 aa  51.2  0.000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 82 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 76 aa  50.4  0.000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 		 321 aa  50.4  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 		 83 aa  50.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  34.62 
 
 		 96 aa  50.4  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  42.42 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  30.43 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 76 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 73 aa  50.1  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  43.33 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 73 aa  49.3  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 87 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  36.67 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  30.43 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>