241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2192 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
82 aa  154  5.0000000000000005e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
81 aa  152  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  95.12 
 
 
122 aa  148  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  92.68 
 
 
111 aa  144  3e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  92.68 
 
 
82 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  92.68 
 
 
82 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  91.36 
 
 
81 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  91.36 
 
 
81 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  91.36 
 
 
81 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  91.36 
 
 
81 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  83.95 
 
 
81 aa  116  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  91.36 
 
 
81 aa  115  1.9999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  93.33 
 
 
81 aa  110  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  93.22 
 
 
82 aa  110  8.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  86.42 
 
 
81 aa  109  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  91.67 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  91.67 
 
 
81 aa  108  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  91.38 
 
 
81 aa  107  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  62.5 
 
 
74 aa  82.8  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  54.17 
 
 
91 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  54.17 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  51.25 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  54.17 
 
 
91 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  52.78 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  47.44 
 
 
96 aa  76.6  0.0000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  52.78 
 
 
91 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 
93 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  56.58 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  42.68 
 
 
92 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 
93 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  67.24 
 
 
109 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  55 
 
 
107 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  65.45 
 
 
90 aa  74.7  0.0000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  51.35 
 
 
91 aa  74.7  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  50.7 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  45.12 
 
 
93 aa  74.3  0.0000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  42.68 
 
 
93 aa  73.9  0.0000000000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  48 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  46.25 
 
 
88 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  41.67 
 
 
95 aa  72.8  0.000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  53.62 
 
 
91 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  52.11 
 
 
321 aa  72  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  42.68 
 
 
93 aa  72  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  47.5 
 
 
82 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
82 aa  70.9  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  63.79 
 
 
109 aa  70.9  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  53.33 
 
 
83 aa  70.5  0.000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  47.5 
 
 
82 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  63.64 
 
 
107 aa  70.1  0.00000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  48.75 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  52.78 
 
 
86 aa  68.9  0.00000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  60.71 
 
 
106 aa  68.6  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  60.71 
 
 
96 aa  68.2  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  51.47 
 
 
76 aa  67.4  0.00000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  47.22 
 
 
88 aa  67  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  46.48 
 
 
96 aa  66.6  0.0000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  46.91 
 
 
91 aa  66.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  45.12 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  44.16 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  51.25 
 
 
82 aa  65.5  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  46.75 
 
 
100 aa  66.2  0.0000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  46.91 
 
 
83 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  43.9 
 
 
93 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  47.95 
 
 
91 aa  63.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  45.59 
 
 
77 aa  63.5  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 
88 aa  62.8  0.000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  52.46 
 
 
79 aa  62  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  65.38 
 
 
101 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  39.02 
 
 
93 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  43.9 
 
 
94 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  42.5 
 
 
107 aa  61.2  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  48.39 
 
 
77 aa  60.5  0.000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  36.59 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  50.88 
 
 
74 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  36.59 
 
 
82 aa  59.7  0.00000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  42.25 
 
 
76 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  57.69 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  48 
 
 
90 aa  59.3  0.00000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  47.37 
 
 
185 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  50.68 
 
 
80 aa  57.8  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 
70 aa  57.8  0.00000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  43.66 
 
 
78 aa  57.8  0.00000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  43.42 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  40.91 
 
 
72 aa  57.4  0.00000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  43.42 
 
 
76 aa  57.4  0.00000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>