133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A1656 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  76.34 
 
 		 93 aa  150  7e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  76.09 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  72.04 
 
 		 93 aa  140  5e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  71.74 
 
 		 92 aa  137  4.999999999999999e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  69.47 
 
 		 95 aa  136  7.999999999999999e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  66.3 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  73.12 
 
 		 93 aa  127  5.0000000000000004e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  67.82 
 
 		 96 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  67.74 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  70.97 
 
 		 93 aa  120  7e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  78.57 
 
 		 91 aa  118  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  68.54 
 
 		 94 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  62.82 
 
 		 82 aa  95.5  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  61.54 
 
 		 82 aa  95.1  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  93.6  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  61.84 
 
 		 82 aa  92.4  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  59.21 
 
 		 86 aa  92  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  56.96 
 
 		 83 aa  90.9  5e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  90.9  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  59.21 
 
 		 83 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  60.81 
 
 		 80 aa  85.5  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  48.05 
 
 		 88 aa  84  7e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  46.07 
 
 		 91 aa  83.2  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  49.43 
 
 		 88 aa  82  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1124  F0F1 ATP synthase subunit C  62.03 
 
 		 81 aa  81.3  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871314  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  51.32 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  48.78 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  48.78 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  48.78 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  48.78 
 
 		 81 aa  79.3  0.00000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 82 aa  78.2  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 122 aa  77.8  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1052  F0F1 ATP synthase subunit C  57.14 
 
 		 81 aa  77  0.00000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  54.1 
 
 		 88 aa  75.9  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  42.67 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 91 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 91 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 		 81 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 82 aa  64.7  0.0000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 		 81 aa  64.7  0.0000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 		 96 aa  61.2  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 90 aa  60.5  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  45.61 
 
 		 81 aa  59.7  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 82 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  52.83 
 
 		 107 aa  59.7  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  38.96 
 
 		 321 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  39.73 
 
 		 85 aa  58.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 100 aa  58.5  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 109 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  50.94 
 
 		 106 aa  57  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  37.8 
 
 		 107 aa  56.6  0.0000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.54 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  50.91 
 
 		 109 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  34.21 
 
 		 100 aa  55.5  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  44.83 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  38.57 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 96 aa  53.5  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 112 aa  52  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  35.53 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  35.71 
 
 		 74 aa  51.2  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  38.16 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  37.14 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  37.14 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  37.14 
 
 		 76 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  30.43 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  37.7 
 
 		 77 aa  48.9  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  44.19 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  32.89 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  44 
 
 		 82 aa  47.8  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  40.74 
 
 		 77 aa  47.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  43.14 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  31.58 
 
 		 78 aa  46.6  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  32.1 
 
 		 185 aa  45.4  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  35.62 
 
 		 76 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  35.53 
 
 		 79 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  35 
 
 		 81 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  34.55 
 
 		 77 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  35.42 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  37.74 
 
 		 74 aa  43.5  0.0009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  35.29 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>