120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3054 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 93 aa  183  9e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  90.22 
 
 		 93 aa  166  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  79.35 
 
 		 92 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  76.09 
 
 		 93 aa  147  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  76.09 
 
 		 93 aa  145  2.0000000000000003e-34  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  70.21 
 
 		 95 aa  139  1.9999999999999998e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  70.65 
 
 		 93 aa  137  6e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  80.43 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  68.89 
 
 		 96 aa  130  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  76.09 
 
 		 93 aa  129  1.0000000000000001e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  73.91 
 
 		 93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  82.14 
 
 		 91 aa  121  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  64.84 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  50.56 
 
 		 91 aa  93.2  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  57.69 
 
 		 82 aa  91.7  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  51.28 
 
 		 88 aa  90.5  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  56.41 
 
 		 82 aa  89.4  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  56.41 
 
 		 82 aa  88.6  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  57.89 
 
 		 83 aa  89.4  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  55.13 
 
 		 86 aa  88.2  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  56.96 
 
 		 83 aa  87.8  5e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  58.97 
 
 		 82 aa  87.4  5e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  53.09 
 
 		 88 aa  87.4  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  56.41 
 
 		 82 aa  87.4  6e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  54.55 
 
 		 88 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  59.46 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  57.38 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  47.56 
 
 		 81 aa  78.2  0.00000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 82 aa  77  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 122 aa  76.6  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 111 aa  76.3  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 91 aa  74.7  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  43.33 
 
 		 91 aa  74.3  0.0000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1124  F0F1 ATP synthase subunit C  56.96 
 
 		 81 aa  74.3  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.871314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1052  F0F1 ATP synthase subunit C  56.06 
 
 		 81 aa  73.9  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  44.3 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  41.77 
 
 		 91 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  39.29 
 
 		 91 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  45.71 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  40.51 
 
 		 91 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  65.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  49.15 
 
 		 81 aa  64.3  0.0000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 82 aa  63.9  0.0000000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  63.9  0.0000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  46.34 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  63.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  62.8  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  40.85 
 
 		 96 aa  63.2  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.44 
 
 		 85 aa  63.5  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 90 aa  61.6  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  56.6 
 
 		 107 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  37.14 
 
 		 321 aa  61.2  0.000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  55.56 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  40.54 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  45.61 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 82 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  48.21 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  34.72 
 
 		 100 aa  55.8  0.0000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  46.43 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  35.8 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  37.14 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1389  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  33.78 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1201  ATP synthase F0 sector, C subunit  35.53 
 
 		 107 aa  53.5  0.0000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.539498  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 103 aa  53.1  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  44 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  43.1 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1014  F0F1 ATP synthase subunit C  34.72 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0943  F0F1 ATP synthase subunit C  34.72 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0878  F0F1 ATP synthase subunit C  34.72 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00312668  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  34.29 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0646  ATP synthase C chain (Lipid-binding protein)(dicyclohexylcarbodiimide-binding protein)  43.14 
 
 		 93 aa  48.9  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.643496  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0957  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1502  F0F1 ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  28.99 
 
 		 77 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  34.25 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  34.25 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  39.29 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  42.31 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  34.43 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  32.39 
 
 		 76 aa  44.7  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  30 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1300  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185827  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  30 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  30 
 
 		 76 aa  44.3  0.0005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0429  F0F1 ATP synthase subunit C  38.18 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.00000000000398633  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  35.19 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  39.62 
 
 		 74 aa  43.9  0.0008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>