160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0800 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  100 
 
 		 321 aa  619  1e-176  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  45.64 
 
 		 185 aa  111  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  53.16 
 
 		 83 aa  76.6  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  53.42 
 
 		 82 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  53.42 
 
 		 82 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  72.55 
 
 		 82 aa  75.5  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  53.42 
 
 		 111 aa  75.5  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  52.11 
 
 		 81 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  52.05 
 
 		 122 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  51.43 
 
 		 96 aa  72  0.00000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  33.33 
 
 		 232 aa  68.2  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1266  H(+)-transporting two-sector ATPase  30.72 
 
 		 606 aa  67  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  42.25 
 
 		 95 aa  64.7  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  45.33 
 
 		 96 aa  64.7  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  38.75 
 
 		 93 aa  64.3  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0553  V-type ATP synthase subunit K  29.54 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.651546  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0294  V-type ATP synthase subunit K  29.54 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.620174 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1619  V-type ATP synthase subunit K  29.54 
 
 		 222 aa  64.3  0.000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.573628  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  47.95 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  47.95 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  47.95 
 
 		 76 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  38.57 
 
 		 93 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 94 aa  61.6  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  38.03 
 
 		 93 aa  61.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  37.14 
 
 		 93 aa  61.2  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  37.14 
 
 		 92 aa  60.5  0.00000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  38.16 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  38.96 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  38.36 
 
 		 88 aa  58.9  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  44.93 
 
 		 91 aa  58.5  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0061  V-type ATP synthase subunit K  28.94 
 
 		 223 aa  58.9  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  38.03 
 
 		 88 aa  58.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  42.31 
 
 		 83 aa  58.5  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  57.4  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  57.4  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  41.43 
 
 		 91 aa  57.8  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  57  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  57  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  47.37 
 
 		 81 aa  57  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  43.48 
 
 		 91 aa  57  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0363  V-type ATP synthase subunit K  28.27 
 
 		 222 aa  57  0.0000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.100605  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  44.62 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0947  F0F1 ATP synthase subunit C  39.34 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0801028  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  39.51 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2331  F0F1 ATP synthase subunit C  39.51 
 
 		 93 aa  55.8  0.0000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  53.52 
 
 		 81 aa  55.8  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  45.61 
 
 		 81 aa  55.1  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0601  ATP synthase F0, C subunit  36.36 
 
 		 100 aa  55.5  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.112186  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  42.65 
 
 		 104 aa  54.7  0.000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3101  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 91 aa  54.7  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00136484  normal  0.204805 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 82 aa  54.7  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.79 
 
 		 74 aa  55.1  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 78 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  41.1 
 
 		 75 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  47.46 
 
 		 81 aa  54.3  0.000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 82 aa  53.9  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1604  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 90 aa  53.5  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  39.74 
 
 		 82 aa  53.5  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0330  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 		 87 aa  53.5  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 82 aa  53.1  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2794  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 		 107 aa  53.1  0.000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.196475  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  38.57 
 
 		 93 aa  53.1  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  48.21 
 
 		 81 aa  52.8  0.000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  42.03 
 
 		 86 aa  52.8  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  54.17 
 
 		 86 aa  52.8  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 81 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  45.76 
 
 		 81 aa  52.8  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  40.32 
 
 		 80 aa  52.8  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  40.35 
 
 		 91 aa  52.8  0.000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 82 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0134  H+transporting two-sector ATPase C subunit  33.8 
 
 		 85 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.331941  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  33.77 
 
 		 81 aa  52  0.00001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2086  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 106 aa  51.2  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000184566  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  38.46 
 
 		 82 aa  51.6  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  43.33 
 
 		 90 aa  51.6  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0631  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 96 aa  51.6  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000562654  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 73 aa  51.6  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2700  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4471  H+transporting two-sector ATPase C subunit  52 
 
 		 114 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1281  F0F1 ATP synthase subunit C  32.22 
 
 		 100 aa  50.8  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0847  ATP synthase F0, C subunit  34.25 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2067  ATP synthase F0, C subunit  41.51 
 
 		 109 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.107619 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2701  ATP synthase F0, C subunit  40.38 
 
 		 101 aa  50.4  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.025291  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  39.13 
 
 		 77 aa  50.4  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 78 aa  50.1  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  42.25 
 
 		 89 aa  50.1  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 73 aa  49.7  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2255  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 107 aa  49.3  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.139541  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  32.47 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  32.47 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  39.66 
 
 		 83 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  37.88 
 
 		 82 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1052  F0F1 ATP synthase subunit C  42.86 
 
 		 81 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>