160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0330 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009718  Fnod_0330  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 87 aa  169  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  61.97 
 
 		 96 aa  97.1  7e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0295  F0F1 ATP synthase subunit C  71.6 
 
 		 83 aa  92.8  1e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1176  F0F1 ATP synthase subunit C  65.85 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.575473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1278  F0F1 ATP synthase subunit C  65.85 
 
 		 85 aa  86.7  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.453948  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  50.59 
 
 		 83 aa  79.7  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  48.48 
 
 		 321 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  47.37 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  46.15 
 
 		 111 aa  67.8  0.00000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  46.05 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  46.05 
 
 		 82 aa  67  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 81 aa  66.2  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  48.53 
 
 		 76 aa  64.3  0.0000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  37.33 
 
 		 96 aa  57  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  37.84 
 
 		 185 aa  57  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 92 aa  55.1  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  50.98 
 
 		 82 aa  54.7  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0181  ATP synthase C chain  37.68 
 
 		 100 aa  53.5  0.0000009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  42.65 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  42.42 
 
 		 79 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2143  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 		 92 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  34.94 
 
 		 93 aa  52.4  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 70 aa  52.8  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  39.19 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 81 aa  52  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 81 aa  51.2  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  37.33 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  41.18 
 
 		 77 aa  51.2  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  34.33 
 
 		 93 aa  51.2  0.000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  41.18 
 
 		 104 aa  50.8  0.000006  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  30.67 
 
 		 95 aa  50.8  0.000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  46.43 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 81 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  44.74 
 
 		 82 aa  50.1  0.000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.11 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  31.08 
 
 		 93 aa  50.1  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0246  ATP synthase F0, C subunit  41.33 
 
 		 78 aa  50.1  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.701859  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  42.19 
 
 		 74 aa  49.3  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0198  ATP synthase F0, C subunit  50 
 
 		 78 aa  48.9  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000179911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  33.85 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  44.44 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  38.37 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4249  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000950029  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  29.73 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  44.44 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  35.63 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 82 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3360  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  47.8  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000392065  hitchhiker  0.00459127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  44.64 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3143  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00841289  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2849  F0F1 ATP synthase subunit C  48.89 
 
 		 86 aa  47.4  0.00007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  52.17 
 
 		 81 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4016  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.64478e-25 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3932  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 91 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000044416  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  33.8 
 
 		 76 aa  47.4  0.00007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2029  F0F1 ATP synthase subunit C  34.21 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000094823  normal  0.0236487 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2332  F0F1 ATP synthase subunit C  34.21 
 
 		 82 aa  47  0.00009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000050881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0016  ATP synthase F0, C subunit  34.33 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000229893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  34.85 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  40.98 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0367  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.467812  normal  0.384137 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  36.49 
 
 		 89 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0188  F0F1 ATP synthase subunit C  32.89 
 
 		 81 aa  46.2  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00450666 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  38.33 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0468  F0F1 ATP synthase subunit C  36.92 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.160143 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0250  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 		 82 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.436131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  50 
 
 		 82 aa  45.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  40.62 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  44.78 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0298  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104912  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  43.28 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0303  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0073525 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1056  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45 
 
 		 65 aa  45.1  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0415  F0F1 ATP synthase subunit C  36.76 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.233607  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>