151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_1278 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009486  Tpet_1176  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 85 aa  164  5e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.575473  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1278  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 85 aa  164  5e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.453948  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  70.37 
 
 		 96 aa  114  3.9999999999999997e-25  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0295  F0F1 ATP synthase subunit C  82.5 
 
 		 83 aa  102  1e-21  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0330  F0F1 ATP synthase subunit C  65.85 
 
 		 87 aa  88.6  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  52.94 
 
 		 321 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  56.06 
 
 		 83 aa  69.7  0.00000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  49.28 
 
 		 76 aa  65.1  0.0000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1548  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  42.86 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_16571  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.95353  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16341  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.504345  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16451  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 81 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.421264  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0985  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18531  F0F1 ATP synthase subunit C  46.88 
 
 		 82 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.504611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15741  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 77 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_04791  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 122 aa  57  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0802  ATP synthase F0, C subunit  52.94 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  43.48 
 
 		 104 aa  54.7  0.0000004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0440  F0F1 ATP synthase subunit C  37.5 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.100541  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  39.53 
 
 		 109 aa  54.3  0.0000005  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  39.06 
 
 		 92 aa  53.9  0.0000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2850  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 		 185 aa  54.3  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0959232 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  43.08 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1435  F0F1 ATP synthase subunit C  48.21 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.213661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1656  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 93 aa  52  0.000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4101  F0F1 ATP synthase subunit C  44.29 
 
 		 83 aa  52.4  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00000110269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0045  F0F1 ATP synthase subunit C  48.48 
 
 		 82 aa  52  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0943976 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  38.55 
 
 		 78 aa  51.6  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 93 aa  51.6  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  38.57 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  36.36 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2994  F0F1 ATP synthase subunit C  43.94 
 
 		 94 aa  50.8  0.000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  32.86 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2332  hypothetical protein  42.11 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2777  F0F1 ATP synthase subunit C  45.71 
 
 		 86 aa  50.1  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.787943  normal  0.376194 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 79 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0062  ATP synthase F0 subunit C  42.62 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2716  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19720  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 82 aa  48.9  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00460397  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3387  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.0000140393  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0128  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1051  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1068  F0F1 ATP synthase subunit C  32.81 
 
 		 93 aa  48.9  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0424  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173635  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1295  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.490401  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2623  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 81 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.989267 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2789  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2647  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0152  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0463692  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1516  ATP synthase F0, C subunit  46.88 
 
 		 75 aa  48.5  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000666006 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  36.14 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  47.8  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  35.82 
 
 		 76 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1166  F0F1 ATP synthase subunit C  32.81 
 
 		 93 aa  47.4  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.214234  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  40.3 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  42.11 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5555  F0F1 ATP synthase subunit C  44.62 
 
 		 82 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0972976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1488  F0F1 ATP synthase subunit C  45.28 
 
 		 82 aa  47  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.300994  normal  0.898049 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1974  ATP synthase F0, C subunit  44.23 
 
 		 73 aa  47  0.00009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00289  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0484  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2192  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 82 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3334  ATP synthase F0 subunit C  45.28 
 
 		 81 aa  47  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  35.38 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1883  F0F1 ATP synthase subunit C  43.08 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.099934  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  43.86 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0517  ATP synthase F0, C subunit  45.28 
 
 		 77 aa  46.2  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.959097  normal  0.580721 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  33.85 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  35.38 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  35.38 
 
 		 72 aa  46.2  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  34.33 
 
 		 70 aa  46.2  0.0002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0171  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.35 
 
 		 96 aa  45.4  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.251186  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  41.67 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2142  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  39.06 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1052  F0F1 ATP synthase subunit C  47.54 
 
 		 81 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 91 aa  45.4  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2603  ATP synthase F0, C subunit  39.39 
 
 		 73 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.239607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  38.57 
 
 		 74 aa  45.1  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  46.67 
 
 		 87 aa  45.1  0.0004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>