58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0696 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 74 aa  138  1.9999999999999998e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  82.81 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  82.81 
 
 		 75 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  81.25 
 
 		 75 aa  107  5e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  83.61 
 
 		 75 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  80.33 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  80.33 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  80.33 
 
 		 75 aa  102  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  93.75 
 
 		 75 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.88 
 
 		 75 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  71.88 
 
 		 75 aa  93.2  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  76.27 
 
 		 76 aa  93.2  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  70.31 
 
 		 75 aa  92  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  70.31 
 
 		 75 aa  92  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  68.75 
 
 		 75 aa  91.3  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  73.77 
 
 		 75 aa  89.7  1e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  74.19 
 
 		 75 aa  89  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.46 
 
 		 76 aa  84.7  4e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  72.41 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  63.51 
 
 		 75 aa  80.5  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  68.97 
 
 		 77 aa  79.3  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  63.01 
 
 		 74 aa  77.8  0.00000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.15 
 
 		 74 aa  77.4  0.00000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  78.12 
 
 		 75 aa  74.7  0.0000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.53 
 
 		 75 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  67.61 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  67.61 
 
 		 78 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  59.46 
 
 		 75 aa  70.1  0.000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  68.66 
 
 		 71 aa  69.3  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  66.22 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  78.69 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  48.65 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  67.35 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  67.35 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  44.59 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  64.86 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.59 
 
 		 77 aa  52.4  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  36.99 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  41.67 
 
 		 73 aa  45.4  0.0002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  33.82 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  37.14 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  39.66 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  38.67 
 
 		 76 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0800  ATP synthase F0, C subunit  40.58 
 
 		 321 aa  41.6  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  40.3 
 
 		 69 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  35.21 
 
 		 104 aa  40.8  0.007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1270  ATP synthase F0, C subunit  36.49 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  35.29 
 
 		 101 aa  40  0.01  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>