60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1978 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 75 aa  137  7e-32  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  74.32 
 
 		 74 aa  105  2e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.92 
 
 		 76 aa  100  5e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  81.08 
 
 		 75 aa  89.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.75 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.75 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  65.62 
 
 		 75 aa  84.3  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.06 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.79 
 
 		 74 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.06 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  65.62 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  65.62 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  68.85 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  64.06 
 
 		 75 aa  80.9  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  67.21 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  66.67 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  65.15 
 
 		 74 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  63.93 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  63.93 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  63.93 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  66.1 
 
 		 77 aa  75.1  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  64.91 
 
 		 76 aa  72.8  0.000000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  67.19 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  64.71 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  64.71 
 
 		 78 aa  71.2  0.000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  64.71 
 
 		 71 aa  71.2  0.000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  67.86 
 
 		 74 aa  68.9  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  61.33 
 
 		 75 aa  66.2  0.0000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  49.33 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  69.12 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  69.39 
 
 		 74 aa  63.9  0.0000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  45.33 
 
 		 75 aa  63.2  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  64.06 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  44 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.54 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  66.22 
 
 		 75 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  62.3 
 
 		 75 aa  52.8  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 73 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.27 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  36.11 
 
 		 75 aa  48.9  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  35.71 
 
 		 109 aa  46.2  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  39.73 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  44.12 
 
 		 78 aa  43.5  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4339  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.12208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4475  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 76 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4486  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 79 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862141  normal  0.124516 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  44.62 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0533  ATP synthase F0, C subunit  43.04 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00274514  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0559  ATP synthase F0, C subunit  43.04 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0247806  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_498  ATP synthase F0, C subunit  43.04 
 
 		 76 aa  41.6  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00034769  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.94 
 
 		 70 aa  41.2  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 		 91 aa  40.8  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4494  ATP synthase F0, C subunit  45.16 
 
 		 76 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0312  ATP synthase F0, C subunit  37.33 
 
 		 75 aa  40.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.103627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>