46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0742 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 76 aa  142  2e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  84 
 
 		 75 aa  93.6  9e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  70.97 
 
 		 75 aa  88.2  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  59.46 
 
 		 74 aa  84.7  4e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  57.75 
 
 		 74 aa  76.6  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  56.25 
 
 		 75 aa  73.6  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  57.81 
 
 		 75 aa  73.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  54.69 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  59.09 
 
 		 74 aa  70.5  0.000000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  60.34 
 
 		 76 aa  68.6  0.00000000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  59.46 
 
 		 75 aa  68.2  0.00000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  54.1 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  54.1 
 
 		 75 aa  66.6  0.0000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  45.95 
 
 		 75 aa  65.1  0.0000000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  58.11 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  54.24 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.36 
 
 		 74 aa  60.5  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  55.22 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  55.22 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  55.22 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  56.25 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  59.38 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  39.73 
 
 		 75 aa  55.8  0.0000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  40.54 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  62.79 
 
 		 78 aa  53.1  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  62.79 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.1 
 
 		 75 aa  51.6  0.000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  57.38 
 
 		 75 aa  50.8  0.000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  55.74 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  43.64 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60 
 
 		 75 aa  47  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  33.82 
 
 		 109 aa  43.1  0.001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  42.25 
 
 		 232 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>