63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_2698 on replicon NC_009049
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 78 aa  129  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 		 71 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  77.94 
 
 		 74 aa  95.9  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  84.51 
 
 		 78 aa  88.6  3e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  68.66 
 
 		 74 aa  87.4  6e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  88.24 
 
 		 74 aa  86.3  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  70 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  64.71 
 
 		 74 aa  80.5  0.000000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  55.22 
 
 		 76 aa  73.2  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.79 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.79 
 
 		 75 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.79 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  68.42 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  63.79 
 
 		 75 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  62.07 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  67.27 
 
 		 75 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  58.62 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  58.62 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  56.9 
 
 		 75 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  58.21 
 
 		 75 aa  62.4  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  56.36 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  57.89 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  70.69 
 
 		 75 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  54.55 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  54.55 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  54.55 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  56.86 
 
 		 75 aa  58.2  0.00000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  52.73 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  56.86 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  45.59 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  43.28 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  33.33 
 
 		 109 aa  53.1  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  66.67 
 
 		 75 aa  53.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  38.24 
 
 		 75 aa  50.4  0.000007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  38.81 
 
 		 74 aa  47.8  0.00005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  36.92 
 
 		 75 aa  47.8  0.00006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17860  ATP synthase F0, C subunit  38.81 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  37.68 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl110  ATP synthase subunit C  38.81 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  54.9 
 
 		 75 aa  45.4  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  65.45 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0893  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit C  33.8 
 
 		 95 aa  44.3  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.716211  normal  0.154695 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  37.68 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2383  ATP synthase F0, C subunit  45.45 
 
 		 74 aa  42.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0446652 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0600  ATP synthase F0, C subunit  35.59 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1501  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.766921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3054  F0F1 ATP synthase subunit C  33.8 
 
 		 93 aa  42  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0952  ATP synthase F0, C subunit  37.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.146117  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  34.33 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2615  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 81 aa  41.2  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.632926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0750  ATP synthase F0, C subunit  30.56 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.249454  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4067  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 		 77 aa  40.8  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0293539  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0332  F0F1 ATP synthase subunit C  41.82 
 
 		 81 aa  40.8  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.708113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1959  F0F1 ATP synthase subunit C  33.8 
 
 		 93 aa  40.4  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0333  ATP synthase F0, C subunit  35.59 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000631431  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  41.94 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2203  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 		 81 aa  40.4  0.009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0392559  normal  0.227618 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>