56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3821 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3821  H+transporting two-sector ATPase C subunit  100 
 
 		 75 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0382382 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0742  H+transporting two-sector ATPase C subunit  84 
 
 		 76 aa  119  9.999999999999999e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.309871  normal  0.485593 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1978  H+transporting two-sector ATPase C subunit  83.87 
 
 		 75 aa  98.6  3e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0574796 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0696  F0F1 ATP synthase subunit C  66.22 
 
 		 74 aa  93.2  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4378  H+transporting two-sector ATPase C subunit  66.2 
 
 		 74 aa  85.1  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.599204 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0930  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0513  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.265169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3369  ATP synthase F0, C subunit  60.94 
 
 		 75 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0857741  normal  0.937647 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0555  F0F1 ATP synthase subunit C  60.94 
 
 		 75 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4484  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  67.57 
 
 		 75 aa  76.6  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.381405 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6945  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.38 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0137828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3174  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.38 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3498  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.38 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7658  H+transporting two-sector ATPase C subunit  59.38 
 
 		 75 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.076902  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2593  F0F1 ATP synthase subunit C  62.12 
 
 		 74 aa  74.3  0.0000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00154499 
 
 
-
 
NC_004310  BR0383  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0501  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.080455  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0448  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.240151 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0395  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0713  ATP synthase F0, C subunit  60.66 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0869955  normal  0.25149 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0377  F0F1 ATP synthase subunit C  61.4 
 
 		 76 aa  69.7  0.00000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1037  F0F1 ATP synthase subunit C  64.18 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2698  F0F1 ATP synthase subunit C  64.18 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.372965  normal  0.0310898 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0191  F0F1 ATP synthase subunit C  64.18 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0697  F0F1 ATP synthase subunit C  64.06 
 
 		 75 aa  65.5  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2878  F0F1 ATP synthase subunit C  56.9 
 
 		 77 aa  65.5  0.0000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.36602 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0397  F0F1 ATP synthase subunit C  44.59 
 
 		 75 aa  62.8  0.000000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1317  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  59.46 
 
 		 75 aa  62  0.000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3245  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  49.32 
 
 		 75 aa  61.6  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2202  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  60 
 
 		 74 aa  61.2  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.77272  normal  0.39093 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3029  F0F1 ATP synthase subunit C  65.31 
 
 		 74 aa  59.7  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.466847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0768  F0F1 ATP synthase subunit C  65.31 
 
 		 78 aa  59.3  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1892  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.95 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0141 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0845  F0F1 ATP synthase subunit C  62.5 
 
 		 75 aa  57.4  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.428397 
 
 
-
 
NC_002978  WD0428  F0F1 ATP synthase subunit C  43.84 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.505104  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4572  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0913  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.283067  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4815  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.750836 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0829  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.170388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0237  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0268  F0F1 ATP synthase subunit C  60.66 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.755035  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1077  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  68 
 
 		 75 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3675  ATP synthase F0, C subunit  37.5 
 
 		 75 aa  49.7  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1087  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0873  F0F1 ATP synthase subunit C  45.45 
 
 		 73 aa  48.5  0.00003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0152  ATP synthase, C subunit  35.29 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1758  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  46.48 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19238  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0068  ATP synthase F0, C subunit  46.15 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1213  ATP synthase F0, C subunit  45.31 
 
 		 81 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1774  V-type ATP synthase subunit K  42.25 
 
 		 232 aa  41.2  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08130  ATP synthase subunit C  47.69 
 
 		 71 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0880  H+transporting two-sector ATPase C subunit  45.59 
 
 		 69 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0396  H+-transporting two-sector ATPase, C subunit  41.18 
 
 		 77 aa  41.2  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.6305  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2501  ATP synthase F0, C subunit  41.54 
 
 		 78 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0079  ATP synthase F0, subunit c  34.78 
 
 		 101 aa  40.8  0.006  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  30.88 
 
 		 90 aa  40.4  0.009  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>